More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2555 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  99.49 
 
 		 391 aa  802    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  100 
 
 		 391 aa  808    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  58.35 
 
 		 400 aa  478  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  52.32 
 
 		 390 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  56.32 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  51.53 
 
 		 418 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  51.67 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  51.93 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  52.31 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  50.26 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  47.26 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  46.73 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  45.41 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  43.78 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  41.65 
 
 		 391 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  41.88 
 
 		 413 aa  325  8.000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  39.85 
 
 		 396 aa  322  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  42.09 
 
 		 391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  41.99 
 
 		 391 aa  307  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  40.31 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  41.06 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  40.66 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  41.52 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  40 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  40.81 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  40.62 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  40.55 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  40.21 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  40.61 
 
 		 397 aa  298  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  39.55 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  40.81 
 
 		 396 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  39.55 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  39.55 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  39.55 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  39.55 
 
 		 396 aa  295  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  41.06 
 
 		 397 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  40.86 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  40.86 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  36.86 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  39.29 
 
 		 411 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  40.05 
 
 		 400 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  38.38 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  39.59 
 
 		 393 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  39.49 
 
 		 393 aa  285  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  39.85 
 
 		 393 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  38.83 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  39.6 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  35.93 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  35.93 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  36.18 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  36.11 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.86 
 
 		 396 aa  278  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  39.85 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  38.37 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  35.93 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  38.85 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  35.93 
 
 		 396 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  38.22 
 
 		 422 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  39.2 
 
 		 404 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  37.95 
 
 		 425 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  38.94 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  36.22 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  38.94 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  38.94 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  38.69 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  38.94 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  38.19 
 
 		 418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  38.62 
 
 		 397 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  35.13 
 
 		 394 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  35.53 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.53 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.53 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.53 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  39.06 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.89 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.53 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  39.33 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  35.97 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  39.59 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  39.13 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.4 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  40.25 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  39.09 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  35.46 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.5 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  36.48 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  37.37 
 
 		 400 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  37.47 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  37.47 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  37.47 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  37.47 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  37.47 
 
 		 425 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  35.81 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  33.84 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  34.78 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  37.11 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  37.16 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>