More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1714 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  100 
 
 		 404 aa  822    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  66.83 
 
 		 398 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  55.33 
 
 		 396 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  52.97 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  47.76 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  47.51 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  49 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  51.48 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  46.04 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  47.26 
 
 		 399 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  46.52 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  46.27 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  46.27 
 
 		 398 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  47.01 
 
 		 398 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  46.02 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  46.77 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  46.63 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  46.27 
 
 		 398 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  47.75 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  46.9 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  46.7 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  46.7 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  47.1 
 
 		 399 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  46.98 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  45.45 
 
 		 396 aa  322  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  47.61 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  44.95 
 
 		 397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  40.94 
 
 		 391 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  40.6 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  40.1 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  40.81 
 
 		 416 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  37.66 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  40.35 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  38.1 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  39.1 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  37.16 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  38.85 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  36.23 
 
 		 395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  34.99 
 
 		 415 aa  265  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  39.35 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  39.95 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  40.1 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  36.75 
 
 		 390 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  37.19 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  35.16 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  38.07 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  34.49 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  38.31 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  37 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  36.91 
 
 		 396 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  37.59 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  37.5 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  37.59 
 
 		 404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  37.83 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  37.83 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  37.83 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  37.01 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  41.67 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  36.41 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  36.82 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  40.1 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  40.3 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  37.01 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  36.45 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  40.91 
 
 		 405 aa  243  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  37.96 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  36.32 
 
 		 396 aa  242  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  36.93 
 
 		 425 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.86 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  36.72 
 
 		 422 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  36.41 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2689  SAM-dependent methyltransferase  38.01 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  37.71 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  35.73 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  38.69 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.05 
 
 		 397 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  35.91 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  36.25 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  35.15 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.35 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.24 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  36.21 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  35.82 
 
 		 396 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  33.5 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  35.32 
 
 		 396 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  35.32 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  39.16 
 
 		 408 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  35.32 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  35.32 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  35.32 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  36.7 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  36.7 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  36.7 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  36.7 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  34.58 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  36.7 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  35.8 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  36.64 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  40.61 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>