More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1954 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 398 aa  791    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2647  SAM-dependent methyltransferase  73.28 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391524  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  70.81 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1304  SAM-dependent methyltransferase  73.03 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.730184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  73.03 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  67.01 
 
 		 400 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2689  SAM-dependent methyltransferase  61.32 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  46.56 
 
 		 416 aa  332  9e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  37.94 
 
 		 399 aa  278  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  40.51 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  40.51 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  36.64 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  40.2 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  35.97 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  40.81 
 
 		 403 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  38.64 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  38.64 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  38.38 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.1 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  38.38 
 
 		 398 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  38.38 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  38.13 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  37.22 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  38.13 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  39.39 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  41.31 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  38.64 
 
 		 398 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  38.38 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  38.64 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  36.06 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  36.62 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  36.02 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  35.94 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  39.54 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  36.27 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  39.34 
 
 		 402 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  38.23 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  31.25 
 
 		 391 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  33.92 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  31.25 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  33.78 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  34.76 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  33.67 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  34.68 
 
 		 393 aa  208  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  30.99 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  32.73 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  30.89 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  33.5 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  33.25 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  39.14 
 
 		 391 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  33.68 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  35.19 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.92 
 
 		 398 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.4 
 
 		 400 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.75 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  32.21 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.21 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  34.78 
 
 		 394 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  32.12 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  35.09 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  35.15 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  31.23 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  34.94 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  35.06 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  30.56 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  30.46 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  31.95 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  34.31 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  33.82 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  29.71 
 
 		 394 aa  189  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  33.82 
 
 		 404 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  34.11 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  32.99 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  37.53 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  35.7 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  35.52 
 
 		 397 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  33.82 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  33.82 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  33.82 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  30.21 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  35.43 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  35.7 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  34.18 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1268  SAM dependent methyl transferase  32.51 
 
 		 394 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0340735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  32.39 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  32.59 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  32.4 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  32.08 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  30.81 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  32.84 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  32.66 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  33.17 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  29.69 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  34.6 
 
 		 395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  34.34 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  31.7 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.62 
 
 		 479 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  31.73 
 
 		 396 aa  179  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  32.63 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>