More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1304 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  93.94 
 
 		 427 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1304  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 396 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.730184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2647  SAM-dependent methyltransferase  99.49 
 
 		 396 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  73.03 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  73.42 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  69.72 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2689  SAM-dependent methyltransferase  62.24 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  47.19 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  39.24 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  40.77 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  40.77 
 
 		 407 aa  263  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  40.45 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  40.45 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  40.45 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  40.2 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  40.95 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  39.7 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  39.45 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.36 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  40.7 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  39.75 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  38.94 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  40.05 
 
 		 396 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  40.2 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  36.52 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  40.56 
 
 		 403 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  36.06 
 
 		 398 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  40 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  38.31 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.91 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  37.11 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  34.96 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  38.4 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  36.39 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  37.97 
 
 		 396 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  36.27 
 
 		 396 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  39.78 
 
 		 426 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.03 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  36.34 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  37.63 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  32.03 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  38.04 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  39.71 
 
 		 402 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  34.18 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  31.79 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  38.42 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  31.93 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  36 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  38.3 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.89 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  36.63 
 
 		 404 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  36.48 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  34.28 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  35.5 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  34.81 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  34.67 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  31.94 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.18 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  35.15 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  34.66 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  35.64 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  34.35 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  38.73 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.6 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  34.51 
 
 		 397 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.65 
 
 		 394 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  34.58 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  32.64 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  34.66 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  32.35 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  34.66 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  34.66 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  34.66 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  32.32 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  36.71 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.65 
 
 		 389 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  34.43 
 
 		 425 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  34.7 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.77 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  34 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  33.18 
 
 		 479 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  30 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  36.07 
 
 		 389 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  33.42 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  36.34 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  36.07 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  34.53 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  33.76 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  30.5 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  33.91 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  32.76 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  33.94 
 
 		 552 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  33.25 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  34.94 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>