More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2043 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  100 
 
 
402 aa  800    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  56.53 
 
 
403 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  54.87 
 
 
398 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  53.08 
 
 
398 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  54.36 
 
 
398 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  54.62 
 
 
398 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  52.82 
 
 
398 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  54.1 
 
 
397 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  52.82 
 
 
398 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  52.54 
 
 
399 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  52.31 
 
 
398 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  52.31 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  52.31 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  50.64 
 
 
398 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  51.02 
 
 
399 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  53.87 
 
 
396 aa  393  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  48.2 
 
 
398 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  52.08 
 
 
426 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  48.98 
 
 
398 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  48.08 
 
 
396 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  50.26 
 
 
407 aa  355  6.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  50 
 
 
407 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  47.42 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  49.74 
 
 
398 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  47.49 
 
 
404 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  42.68 
 
 
396 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  42.67 
 
 
397 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  41.13 
 
 
392 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  42.56 
 
 
416 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  39.03 
 
 
391 aa  269  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  40.66 
 
 
392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  36.13 
 
 
393 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.02 
 
 
393 aa  257  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  37.63 
 
 
393 aa  257  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.25 
 
 
391 aa  252  7e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.04 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.51 
 
 
391 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  42.67 
 
 
391 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  34.54 
 
 
418 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  40.56 
 
 
389 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  35.97 
 
 
393 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  34.37 
 
 
394 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  35.68 
 
 
390 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  41.31 
 
 
389 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  35.9 
 
 
394 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  34.69 
 
 
400 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  33.59 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  39.9 
 
 
413 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  34.53 
 
 
395 aa  239  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  41.06 
 
 
389 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  33.42 
 
 
415 aa  238  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  41.31 
 
 
389 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  32.99 
 
 
389 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  36.32 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  40.76 
 
 
400 aa  232  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  30.45 
 
 
388 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  35.12 
 
 
409 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  31.81 
 
 
391 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  38.62 
 
 
398 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  34.69 
 
 
394 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  36.96 
 
 
397 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  34.03 
 
 
390 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  36.39 
 
 
395 aa  224  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  35.88 
 
 
395 aa  222  9e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  40.61 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  35.68 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  31.3 
 
 
391 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.82 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  35.17 
 
 
422 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  36.64 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  35.61 
 
 
397 aa  215  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  38.48 
 
 
388 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  34.11 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.18 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  34.34 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  34.85 
 
 
396 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  34.33 
 
 
403 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  34.5 
 
 
403 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  34.5 
 
 
403 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  34.5 
 
 
403 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  35.77 
 
 
397 aa  212  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  34.34 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  34.5 
 
 
403 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  34.9 
 
 
394 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  34.34 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.34 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.34 
 
 
396 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  34.26 
 
 
391 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.09 
 
 
396 aa  211  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  36.36 
 
 
400 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  34.25 
 
 
408 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  33.75 
 
 
398 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  34.99 
 
 
394 aa  206  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  33.83 
 
 
396 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  33.83 
 
 
396 aa  206  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  33.83 
 
 
396 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  32.49 
 
 
396 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  35.97 
 
 
393 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.26 
 
 
397 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.35 
 
 
396 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>