More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2968 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
396 aa  801    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  63.27 
 
 
398 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  62.76 
 
 
398 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  60.46 
 
 
398 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  60.46 
 
 
398 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  60.97 
 
 
398 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  60.71 
 
 
398 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  60.46 
 
 
398 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  60.97 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  61.48 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  60.46 
 
 
398 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  60.77 
 
 
397 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  56.12 
 
 
398 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  58.93 
 
 
403 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  52.3 
 
 
398 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  56.19 
 
 
398 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  53.25 
 
 
399 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  53.06 
 
 
396 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  53.87 
 
 
402 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  53.74 
 
 
426 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  50.65 
 
 
407 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  48.6 
 
 
396 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  50.65 
 
 
407 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  49.36 
 
 
398 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  47.75 
 
 
404 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  46.55 
 
 
396 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  42.09 
 
 
391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  43.44 
 
 
397 aa  308  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  43.26 
 
 
416 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  42.12 
 
 
392 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  41.39 
 
 
392 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  39.48 
 
 
390 aa  286  5.999999999999999e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  37.91 
 
 
395 aa  264  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  34.19 
 
 
415 aa  259  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  37.21 
 
 
393 aa  257  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.73 
 
 
393 aa  256  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  36.02 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  39.84 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  35.48 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  35.77 
 
 
394 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  39.23 
 
 
398 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.5 
 
 
393 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  36.69 
 
 
394 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  36.79 
 
 
394 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  40.46 
 
 
400 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  37.63 
 
 
400 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2689  SAM-dependent methyltransferase  39.69 
 
 
398 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  36.32 
 
 
413 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.38 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.66 
 
 
391 aa  245  8e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  33.92 
 
 
418 aa  245  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  38.73 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.79 
 
 
391 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.23 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  32.23 
 
 
391 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  35.66 
 
 
394 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  37.84 
 
 
397 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  32.99 
 
 
389 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  33.76 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  36.84 
 
 
396 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  36.59 
 
 
396 aa  229  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  36.5 
 
 
396 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  35.91 
 
 
411 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  36.16 
 
 
397 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  34.36 
 
 
394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  39.28 
 
 
400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  35.75 
 
 
396 aa  225  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2647  SAM-dependent methyltransferase  40.05 
 
 
396 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1304  SAM-dependent methyltransferase  40.05 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.730184  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  36 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  36 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  35.5 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  36 
 
 
396 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  36 
 
 
396 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  36 
 
 
396 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  33.81 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  38.78 
 
 
405 aa  219  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  38.38 
 
 
389 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  34.17 
 
 
409 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  38.13 
 
 
389 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  38.13 
 
 
389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.62 
 
 
398 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  32.65 
 
 
388 aa  216  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  36.36 
 
 
396 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0405  SAM-dependent methyltransferase  39.82 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.18 
 
 
400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  33.25 
 
 
416 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  38.78 
 
 
427 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.99 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  35.44 
 
 
400 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  35.44 
 
 
400 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  35.44 
 
 
400 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  35.46 
 
 
388 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  35.7 
 
 
396 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  35.61 
 
 
400 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  32.41 
 
 
395 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  35.79 
 
 
394 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  33 
 
 
396 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  33.25 
 
 
396 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  33.25 
 
 
396 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>