More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1583 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  99.5 
 
 
400 aa  788    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  100 
 
 
400 aa  793    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  99.5 
 
 
400 aa  788    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  86.28 
 
 
408 aa  679    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  37.31 
 
 
415 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  41.93 
 
 
392 aa  276  5e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  38.32 
 
 
396 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  38.32 
 
 
396 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  41.51 
 
 
397 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  38.76 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  38.58 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  38.58 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  38.58 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  38.07 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  38.58 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  38.58 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  38.42 
 
 
391 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.14 
 
 
391 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  38.07 
 
 
396 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  41.52 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  38.32 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  39.4 
 
 
400 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  40 
 
 
411 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  37.72 
 
 
396 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  39.24 
 
 
396 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  38.99 
 
 
396 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  38.99 
 
 
396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  38.73 
 
 
395 aa  265  8e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  38.08 
 
 
393 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  40.87 
 
 
404 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  42.42 
 
 
400 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  39.9 
 
 
397 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  36.96 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  40.36 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  36.96 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  39.9 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  36.96 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  40.89 
 
 
397 aa  262  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  37.63 
 
 
395 aa  262  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  39.09 
 
 
396 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  38.9 
 
 
398 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  38.73 
 
 
397 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  39.6 
 
 
400 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  39.12 
 
 
422 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  39.64 
 
 
396 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  39.64 
 
 
396 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  41.49 
 
 
400 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  39.64 
 
 
396 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  40.1 
 
 
404 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  40.36 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  40.36 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  40.36 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  41.39 
 
 
400 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  42.16 
 
 
412 aa  259  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  37.63 
 
 
396 aa  259  8e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  40.25 
 
 
395 aa  259  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  38.83 
 
 
425 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  39.32 
 
 
396 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  37.97 
 
 
396 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  39.59 
 
 
404 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  39.02 
 
 
423 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  37.82 
 
 
391 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  39.25 
 
 
397 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  40.53 
 
 
396 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  38.58 
 
 
397 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  38.12 
 
 
367 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  38.12 
 
 
367 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  40.8 
 
 
402 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  36.9 
 
 
390 aa  255  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  38.4 
 
 
393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  38.93 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  38.22 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  39.69 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  38.11 
 
 
425 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  38.11 
 
 
425 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  38.11 
 
 
425 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  38.11 
 
 
425 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  38.11 
 
 
425 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  36.25 
 
 
409 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  36.92 
 
 
394 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  37.82 
 
 
418 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  37.25 
 
 
397 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  36.83 
 
 
394 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  37.68 
 
 
479 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  40.58 
 
 
396 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  37.25 
 
 
397 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  36.36 
 
 
392 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  35.53 
 
 
389 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.64 
 
 
418 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  34.95 
 
 
394 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  36.71 
 
 
397 aa  245  9e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  41.01 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  40.26 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  36.36 
 
 
389 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.69 
 
 
393 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  40.92 
 
 
397 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  34.26 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>