More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3333 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 416 aa  839    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  42.56 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  46.56 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  43.26 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  40.1 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  42.2 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  42.2 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  45.45 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  41.94 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  40.92 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  42.2 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  41.03 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  41.22 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  40.92 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  45.92 
 
 		 427 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1304  SAM-dependent methyltransferase  47.19 
 
 		 396 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.730184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  40.66 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2647  SAM-dependent methyltransferase  46.94 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  41.43 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  40.92 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  38.97 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2689  SAM-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  42.82 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  42.23 
 
 		 407 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  42.32 
 
 		 404 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  44.58 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  42.01 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  39.8 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  39.29 
 
 		 391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  39.89 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  39.69 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  40.57 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  43.36 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  39.8 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  40.99 
 
 		 393 aa  266  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  38.9 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  42.56 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  38.3 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  41.58 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  38.66 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  38.13 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  36.43 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  35.6 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  38.28 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  37.72 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  36 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  37.43 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  36.13 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  31.63 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  36.64 
 
 		 394 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.48 
 
 		 391 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  35.48 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  34.63 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  40.16 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  32.82 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  38.12 
 
 		 552 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  31.09 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  35.79 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  32.06 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  35.44 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  33.5 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  37.69 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  30.57 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  37.17 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  32.38 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  37.15 
 
 		 400 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.87 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  36.06 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  36.15 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.2 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.32 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  33.16 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  34.86 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.62 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  35.37 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.87 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  34.61 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  36.48 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  37.28 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  36.39 
 
 		 395 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  34.35 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  35.11 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  35.11 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  35.63 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  35.87 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  35.11 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  35.87 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  35.11 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  35.89 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.63 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  35.87 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  35.99 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  31.36 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  33.59 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.74 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.74 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.01 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.74 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.74 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>