More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4030 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  100 
 
 		 552 aa  1143    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  47.47 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  43.72 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  42.34 
 
 		 389 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  42.08 
 
 		 389 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  42.33 
 
 		 364 aa  280  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  38.58 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  38.52 
 
 		 393 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  38.06 
 
 		 392 aa  233  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  36.02 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  36.13 
 
 		 395 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.5 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  36.53 
 
 		 396 aa  220  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  33.51 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  33.96 
 
 		 394 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  33.89 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  34.04 
 
 		 391 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  34.13 
 
 		 393 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  38.38 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  35.87 
 
 		 407 aa  213  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  34.12 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  35.87 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  36 
 
 		 396 aa  213  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  34.23 
 
 		 400 aa  211  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  34.44 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.31 
 
 		 396 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  35.73 
 
 		 393 aa  209  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.56 
 
 		 397 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  35.58 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.4 
 
 		 395 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  34.31 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  33.66 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.09 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  35.37 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.04 
 
 		 396 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.96 
 
 		 391 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  32.96 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  34.97 
 
 		 411 aa  206  9e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  32.98 
 
 		 418 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  33.62 
 
 		 493 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  33.78 
 
 		 396 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.06 
 
 		 404 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  31.73 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.06 
 
 		 404 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  32.37 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  33.78 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  34.04 
 
 		 390 aa  203  6e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.06 
 
 		 404 aa  203  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  35.96 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  33.51 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.8 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  35.04 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.54 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  31.83 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  32.45 
 
 		 403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  32.45 
 
 		 403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  32.45 
 
 		 403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  32.45 
 
 		 403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  32.45 
 
 		 403 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  33.42 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.54 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  33.87 
 
 		 396 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.54 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  35.32 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  32.53 
 
 		 396 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  34.55 
 
 		 404 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  34.55 
 
 		 404 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  34.55 
 
 		 404 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  34.55 
 
 		 404 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  33.6 
 
 		 396 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  33.07 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.16 
 
 		 397 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  34.83 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  35.54 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  33.6 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  33.6 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  31.82 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  33.6 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  32.82 
 
 		 408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  31.91 
 
 		 397 aa  198  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.51 
 
 		 394 aa  198  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.27 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.27 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.28 
 
 		 396 aa  197  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 405 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  32.87 
 
 		 367 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  32.87 
 
 		 367 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 422 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  33.42 
 
 		 396 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  31.12 
 
 		 397 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1198  hypothetical protein  34.23 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  30.75 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  30.75 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  30.75 
 
 		 396 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  35.68 
 
 		 404 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  35.7 
 
 		 389 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1192  hypothetical protein  33.96 
 
 		 390 aa  193  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>