More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3451 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 396 aa  823    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  58.63 
 
 		 398 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  55.33 
 
 		 404 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  48.1 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  49.1 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  48.84 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  48.84 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  48.07 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  48.07 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  47.81 
 
 		 398 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  48.07 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  48.07 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  47.81 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  48.07 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  47.58 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  48.07 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  48.6 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  45.92 
 
 		 396 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  47.27 
 
 		 399 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  49.31 
 
 		 426 aa  359  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  47.03 
 
 		 407 aa  358  8e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  46.65 
 
 		 398 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  46.77 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  49.1 
 
 		 403 aa  355  8.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  47.42 
 
 		 402 aa  334  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  44.1 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  42.82 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  39.19 
 
 		 391 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  38.72 
 
 		 393 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  38.69 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.94 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  39.2 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  39.69 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  39.53 
 
 		 390 aa  276  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  38.82 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  36.2 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  37.69 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  37.59 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  39.14 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  37.44 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  37.4 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  33.59 
 
 		 415 aa  259  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  39.74 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  34.44 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  39.8 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  34.34 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  36.96 
 
 		 413 aa  250  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  35.7 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  33.59 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  36.34 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  37.63 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  31.25 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  34.55 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  33.76 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  35.4 
 
 		 409 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  33.85 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  36.78 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  36.52 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  34.51 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  33.84 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.52 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  35.19 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.51 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  34.51 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  34.51 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.51 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.6 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  34.51 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  31.73 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  35.73 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  31.73 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  34.26 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  35.44 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.94 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  38.18 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  35.19 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  35.44 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  35.44 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  34.94 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  36.11 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  36.09 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  36.8 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  37.78 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.84 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  35.68 
 
 		 418 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.61 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  34.26 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  36.27 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  34.42 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  34.01 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.77 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  34.01 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.48 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  33.75 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.75 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.75 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.75 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.75 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  36.91 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>