More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1090 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  100 
 
 
391 aa  803    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  64.87 
 
 
396 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  66.58 
 
 
397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  51.93 
 
 
392 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  46.92 
 
 
418 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  46.41 
 
 
390 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  45.66 
 
 
415 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  45.5 
 
 
395 aa  361  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  45.78 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  41.65 
 
 
391 aa  342  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  41.65 
 
 
391 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  41.69 
 
 
389 aa  342  9e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  42.2 
 
 
394 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  43.62 
 
 
413 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  43.37 
 
 
390 aa  325  7e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  41.69 
 
 
394 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  42.86 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  42.39 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  44.02 
 
 
393 aa  306  3e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  43 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  40.3 
 
 
409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  42.09 
 
 
396 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  39.44 
 
 
395 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  39.34 
 
 
398 aa  298  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  42.18 
 
 
391 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  41.86 
 
 
393 aa  295  7e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  40.16 
 
 
391 aa  293  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  40.2 
 
 
394 aa  292  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.94 
 
 
404 aa  292  8e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  39.39 
 
 
391 aa  292  8e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  42.38 
 
 
393 aa  288  9e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  45.04 
 
 
389 aa  288  9e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  40.86 
 
 
396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  40.97 
 
 
396 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  39.58 
 
 
394 aa  285  9e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  40.77 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  40.61 
 
 
396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  40.77 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  40.61 
 
 
396 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  40.77 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  40.77 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  40.77 
 
 
396 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  38.97 
 
 
399 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  36.32 
 
 
425 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  36.1 
 
 
422 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  39.29 
 
 
396 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  41.92 
 
 
426 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  39.19 
 
 
396 aa  280  4e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  37.12 
 
 
439 aa  280  4e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  39.44 
 
 
397 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  38.44 
 
 
396 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  37.91 
 
 
394 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 
416 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  38.73 
 
 
398 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  38.73 
 
 
398 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  38.73 
 
 
398 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  37.47 
 
 
394 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  37.82 
 
 
397 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  39.44 
 
 
411 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  38.73 
 
 
398 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  39.09 
 
 
418 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  38.23 
 
 
398 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  37.31 
 
 
394 aa  276  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  38.23 
 
 
398 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  38.38 
 
 
397 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.85 
 
 
425 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.85 
 
 
425 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  36.73 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  37.34 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.85 
 
 
425 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.85 
 
 
425 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  37.89 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  39.33 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.31 
 
 
423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  38.13 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.85 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  38.68 
 
 
396 aa  273  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  38.48 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  37.97 
 
 
398 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  40.55 
 
 
408 aa  272  9e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  37.84 
 
 
400 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  37.97 
 
 
398 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  38.23 
 
 
398 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  39.39 
 
 
396 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  35.64 
 
 
404 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  37.82 
 
 
398 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  39.14 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  40.26 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  39.59 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 
404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  37.31 
 
 
396 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  35.89 
 
 
404 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  35.89 
 
 
404 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  35.89 
 
 
404 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.64 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  36.59 
 
 
400 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  40 
 
 
407 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  37.15 
 
 
403 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>