More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2745 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  100 
 
 		 426 aa  873    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  56.84 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  56.57 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  54.21 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  56.3 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  53.89 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  53.89 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  53.89 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  54.16 
 
 		 398 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  52.82 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  52.82 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  53.08 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  47.46 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  56.64 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  52.69 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  53.53 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  50.27 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  52.66 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  51.06 
 
 		 402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  54.35 
 
 		 398 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  47.37 
 
 		 396 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  47.63 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  49.18 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  43.87 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  43.6 
 
 		 407 aa  302  9e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  42.32 
 
 		 396 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  41.4 
 
 		 391 aa  280  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  42.97 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  39.12 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  40.85 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  41.44 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  40.35 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  44.28 
 
 		 389 aa  259  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  39.06 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  41.01 
 
 		 392 aa  256  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  36.32 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  39.3 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  37.11 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  39.77 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  36.75 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  38.17 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  38.3 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  36.55 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  35.62 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  34.35 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  35.83 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  34.44 
 
 		 389 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  39.38 
 
 		 391 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  35.54 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  32.87 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.87 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  35.25 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  34.75 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.6 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  34.99 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  34.82 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.78 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  34.77 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  36.73 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  34.15 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  34.15 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  34.15 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  34.15 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  34.03 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  34.15 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  33.68 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  35.24 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  36.81 
 
 		 400 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  34.9 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  34.5 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  37.6 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  33.24 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  32.8 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  32.99 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  35.1 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  31.71 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  40.41 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  33.16 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  33.68 
 
 		 404 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  31.49 
 
 		 388 aa  203  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.79 
 
 		 396 aa  203  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.89 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.97 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.97 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.88 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  34.82 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  34.53 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.05 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  40.42 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  32.66 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  32.74 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.7 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  32.66 
 
 		 396 aa  200  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  35.6 
 
 		 397 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  34.52 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  33 
 
 		 439 aa  199  9e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>