More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0592 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  805    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  59.79 
 
 		 388 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  58.76 
 
 		 391 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  59.28 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  48.72 
 
 		 395 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  45.48 
 
 		 389 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  46.27 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  44.25 
 
 		 392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  43.73 
 
 		 394 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  43.11 
 
 		 394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  44.99 
 
 		 418 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  44.47 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  40.21 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  40.21 
 
 		 391 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  41.09 
 
 		 409 aa  293  5e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  40.15 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  42.01 
 
 		 397 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  37.89 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  37.18 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  37.18 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  38.2 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  36.53 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  37.98 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  38.75 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  39.02 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  39.49 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  37.98 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  36.19 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  37.63 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.47 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  35.64 
 
 		 388 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  37.34 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  37.56 
 
 		 397 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  38.01 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  37.31 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  37.63 
 
 		 418 aa  259  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  36.5 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  36.34 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  36.34 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  36.15 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  35.64 
 
 		 408 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  38.42 
 
 		 389 aa  252  8.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  37.21 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  35.82 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  35.57 
 
 		 396 aa  249  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  36.18 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  36.76 
 
 		 398 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  35.66 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  34.77 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.55 
 
 		 397 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.69 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  34.64 
 
 		 439 aa  246  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  36.66 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  36.69 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  36.36 
 
 		 400 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  36.41 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  37.47 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.75 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  35.35 
 
 		 397 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  36.16 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  36.16 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  36.16 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  36.41 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  34.17 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  35.62 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  34.75 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  37.44 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  34.52 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.26 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  34.26 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  35.44 
 
 		 394 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2204  PUA domain containing protein  36.6 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000936736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  34.26 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.95 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.4 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.4 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.14 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.4 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.4 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.4 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  33.25 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  33.76 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.56 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  36.18 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  33.84 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  33.51 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  34.03 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  34.94 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  33.97 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  34.03 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  34.03 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  31.65 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  31.65 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  31.65 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  31.65 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  35.77 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  31.65 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>