More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0614 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
396 aa  815    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  54.06 
 
 
398 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  55.95 
 
 
397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  56.2 
 
 
398 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  55.19 
 
 
398 aa  448  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  55.44 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  55.19 
 
 
398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  54.43 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  54.68 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  55.44 
 
 
398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  55.58 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  54.94 
 
 
398 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  55.7 
 
 
398 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  53.57 
 
 
398 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  53.42 
 
 
398 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  52.41 
 
 
403 aa  399  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  53.06 
 
 
396 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  50.64 
 
 
399 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  48.48 
 
 
426 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  48.08 
 
 
402 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  45.92 
 
 
396 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  45.41 
 
 
407 aa  343  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  46.9 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  45.15 
 
 
407 aa  342  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  46.56 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  44.08 
 
 
397 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  43.04 
 
 
396 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  41.85 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  38.92 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  39.29 
 
 
391 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  38.44 
 
 
392 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  36.32 
 
 
415 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  36.87 
 
 
393 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  41.16 
 
 
389 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  37.37 
 
 
394 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.62 
 
 
393 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.13 
 
 
418 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  39.89 
 
 
416 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  34.85 
 
 
393 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  36.87 
 
 
393 aa  257  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  37.15 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  35.46 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  36.84 
 
 
413 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  37.79 
 
 
391 aa  249  8e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  37.79 
 
 
391 aa  248  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  36.02 
 
 
394 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  34.09 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  34.38 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  36.67 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  36.54 
 
 
409 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  35.77 
 
 
394 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  34.46 
 
 
390 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  36.27 
 
 
394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.12 
 
 
394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  35.94 
 
 
391 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  34.68 
 
 
394 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.74 
 
 
391 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  32.74 
 
 
391 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  34.78 
 
 
396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  33.51 
 
 
400 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  36.39 
 
 
418 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  34.39 
 
 
416 aa  223  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  32.48 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  33.67 
 
 
396 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  34.69 
 
 
396 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  36.13 
 
 
396 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  36.2 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.44 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.44 
 
 
396 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  31.63 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.91 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  35.68 
 
 
400 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.42 
 
 
403 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  33.42 
 
 
403 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.42 
 
 
403 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.42 
 
 
403 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  34.35 
 
 
397 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.42 
 
 
403 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.83 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.83 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  34.35 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.83 
 
 
396 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  34.43 
 
 
396 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.83 
 
 
396 aa  216  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  36.73 
 
 
400 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  36.65 
 
 
389 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.58 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  34.5 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.91 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  36.39 
 
 
389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  35.75 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  34.78 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  34.78 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  34.78 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  34.43 
 
 
397 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  36.29 
 
 
389 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  34.53 
 
 
396 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  34.53 
 
 
396 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  32.32 
 
 
396 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  32.32 
 
 
396 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>