More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3155 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  86.15 
 
 
396 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  86.15 
 
 
396 aa  717    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  85.64 
 
 
396 aa  708    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  86.4 
 
 
396 aa  719    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
411 aa  850    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  86.15 
 
 
396 aa  717    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  86.15 
 
 
396 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  85.89 
 
 
396 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  93.7 
 
 
397 aa  781    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  86.4 
 
 
396 aa  720    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  85.89 
 
 
396 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  84.89 
 
 
396 aa  701    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  63.89 
 
 
396 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  62.88 
 
 
395 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  61.06 
 
 
397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  62.37 
 
 
396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  61.58 
 
 
418 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  60.55 
 
 
397 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  58.59 
 
 
396 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  58.84 
 
 
396 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  58.84 
 
 
396 aa  484  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  58.84 
 
 
396 aa  487  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  58.52 
 
 
403 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  58.52 
 
 
403 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  58.52 
 
 
403 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  58.33 
 
 
396 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  58.08 
 
 
396 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  58.52 
 
 
403 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  58.52 
 
 
403 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  58.33 
 
 
396 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  58.72 
 
 
391 aa  477  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  55.81 
 
 
396 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  55.3 
 
 
396 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  55.05 
 
 
396 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  55.3 
 
 
396 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  56.31 
 
 
397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  59.07 
 
 
367 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  59.07 
 
 
367 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  53.79 
 
 
397 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  54.82 
 
 
400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  51.39 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  50.5 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  50.25 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  50 
 
 
404 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  50 
 
 
404 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  50 
 
 
404 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  49.38 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  49.75 
 
 
404 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  49.87 
 
 
397 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  48.98 
 
 
397 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  49.25 
 
 
400 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  48.75 
 
 
400 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  49.62 
 
 
397 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  47.04 
 
 
423 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  51.65 
 
 
396 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  50.38 
 
 
394 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  46.59 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  46.92 
 
 
422 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  47.72 
 
 
398 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  47.5 
 
 
400 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  49 
 
 
400 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  45.75 
 
 
425 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  45.52 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  45.52 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  45.52 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  45.52 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  49.75 
 
 
396 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  49.25 
 
 
397 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  48.85 
 
 
394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  50.25 
 
 
396 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  46.76 
 
 
422 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  43.65 
 
 
394 aa  346  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  46.97 
 
 
397 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  46.68 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  45.55 
 
 
395 aa  338  7e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  45.55 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  45.66 
 
 
393 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0903  SAM-dependent methyltransferase  45.68 
 
 
406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  45.13 
 
 
392 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  42.64 
 
 
395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  46.52 
 
 
400 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  41.25 
 
 
418 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  42.24 
 
 
389 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  41.06 
 
 
390 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  39.95 
 
 
415 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  39.29 
 
 
391 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  39.29 
 
 
391 aa  288  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  40.55 
 
 
408 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  43.3 
 
 
400 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  40.85 
 
 
393 aa  279  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  40.15 
 
 
394 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  39.44 
 
 
391 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  41.27 
 
 
394 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  38.52 
 
 
393 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  39.9 
 
 
400 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  40 
 
 
400 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  39.9 
 
 
400 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  37.63 
 
 
391 aa  269  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  38.1 
 
 
391 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  39.1 
 
 
413 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>