More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4225 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  100 
 
 		 394 aa  812    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  44.2 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  45.41 
 
 		 397 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  44.2 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  44.44 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  42.18 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  42.12 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  43.95 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  43.95 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  43.95 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  43.95 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  42.32 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  44.95 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  41.88 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  44.39 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  41.88 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  41.88 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  44.08 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  41.88 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  41.88 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  44.02 
 
 		 396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  43.77 
 
 		 396 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  43.92 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  43.51 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  43.51 
 
 		 396 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  44.7 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  43.99 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  43.72 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  43.5 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  44.39 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  44.39 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  44.39 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  43.77 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  44.39 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  44.39 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  43.5 
 
 		 400 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  43.65 
 
 		 411 aa  346  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  43.25 
 
 		 400 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  43.4 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  42.89 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  43.4 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  41.12 
 
 		 396 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  41.62 
 
 		 396 aa  338  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  41.62 
 
 		 396 aa  338  8e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  41.62 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  41.37 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  41.37 
 
 		 396 aa  335  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  41.69 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  40.86 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  41.58 
 
 		 395 aa  332  6e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  40.1 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  39.85 
 
 		 396 aa  328  7e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  39.85 
 
 		 396 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  42.13 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  40.86 
 
 		 397 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  40.05 
 
 		 403 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  40.05 
 
 		 403 aa  322  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  40.05 
 
 		 403 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  40.05 
 
 		 403 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  40.05 
 
 		 403 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  40.61 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  40.81 
 
 		 422 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  38.83 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  43.4 
 
 		 395 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  40.81 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  43.01 
 
 		 400 aa  315  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  41.52 
 
 		 396 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  41.5 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  41.13 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  42.89 
 
 		 395 aa  311  9e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  39.95 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  43.37 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  43.15 
 
 		 393 aa  308  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  39.14 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  39.75 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  38.36 
 
 		 397 aa  302  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  40.87 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  40.87 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  39.84 
 
 		 395 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  39.55 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  38.58 
 
 		 389 aa  295  7e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.9 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  40.61 
 
 		 393 aa  282  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  38.11 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  39.42 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  39.13 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  37.47 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  39.59 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  38.62 
 
 		 391 aa  276  6e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0903  SAM-dependent methyltransferase  40.74 
 
 		 406 aa  276  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  38.42 
 
 		 397 aa  273  6e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  38.3 
 
 		 396 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  39.75 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  38.14 
 
 		 394 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  35.46 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  35.46 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  39.04 
 
 		 391 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  38.14 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  37.37 
 
 		 393 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  38.01 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>