More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0528 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  100 
 
 		 398 aa  828    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  49.37 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  41.9 
 
 		 393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  39.59 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  38 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  38.35 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.5 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.57 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.57 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.57 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.57 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  35.25 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  35.25 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  35.32 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  35 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  35 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  35.25 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  38.1 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  36.87 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  35 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  38.33 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  36.87 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  35.01 
 
 		 391 aa  255  8e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  38.33 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  38.33 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  38.18 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  37.34 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  36.78 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  37.84 
 
 		 404 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  37.84 
 
 		 404 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  37.84 
 
 		 404 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  36.11 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  36.43 
 
 		 397 aa  249  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  36.36 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  37.34 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  36.36 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  34 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  34.09 
 
 		 396 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  34 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  36.36 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  36.36 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  36.09 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  36.36 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  38.06 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  35.68 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  35.91 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  36.72 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  35.64 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.09 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  33.17 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  37.66 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.68 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  34.36 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  37.38 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  36.2 
 
 		 393 aa  239  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  37.41 
 
 		 397 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  35.28 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  35.29 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  37.19 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.29 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  35.53 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  35.53 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.05 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.05 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  34.26 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.05 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.05 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.05 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.34 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  32.58 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  36.14 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  34.15 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  39.23 
 
 		 408 aa  229  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  34.77 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  33.84 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  37.22 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  33.78 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  33.78 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  36.36 
 
 		 400 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.51 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  33.42 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  33.17 
 
 		 418 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  35.98 
 
 		 396 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  35.01 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  33.17 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  37.91 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  32.91 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  34.6 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  33.01 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  37.91 
 
 		 400 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  37.66 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  33.67 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  36.96 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  34.01 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  35.26 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  34.24 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  33.92 
 
 		 394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  30.38 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>