More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0619 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  796    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  38.25 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  40.83 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  40.67 
 
 		 400 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  40.67 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  40.67 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  35.14 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  35.98 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.14 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  35.28 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  33.67 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  34.29 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  39.9 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  39.6 
 
 		 402 aa  222  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  39.38 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  39.63 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  35.19 
 
 		 393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  34.04 
 
 		 394 aa  216  7e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  39.12 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  34.01 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  33.42 
 
 		 411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  36.57 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  33.76 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  31.57 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  37.05 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  38.12 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  40.51 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  37.24 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  37.12 
 
 		 392 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  38.32 
 
 		 398 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  38.4 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  33.25 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  33.25 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  33.25 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  35.49 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  33.17 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  32.91 
 
 		 396 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  34.34 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  35.19 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.55 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  34.06 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  32.66 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  35.88 
 
 		 401 aa  206  4e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  32.38 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  32.99 
 
 		 397 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  34.59 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  37.22 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  39.95 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  33.16 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  33.51 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.71 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  34.39 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  31.83 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  32.48 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  33.8 
 
 		 479 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  35.97 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  35.97 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  35.97 
 
 		 404 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  35.75 
 
 		 425 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  35.46 
 
 		 404 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  38.81 
 
 		 412 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  36.43 
 
 		 397 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.91 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.91 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.91 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  32.16 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.91 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.91 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  35.77 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  33.25 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  34.01 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  36.27 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  33.59 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.51 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  36.6 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  33.08 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.51 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  34.34 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.51 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.51 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.88 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  32.74 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.51 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  32.74 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  36.08 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  32.74 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  32.74 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  32.74 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  32.74 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  31.19 
 
 		 439 aa  197  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.19 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  37.75 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  32.82 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  31.65 
 
 		 395 aa  196  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  32.15 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  32.15 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  32.39 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  34.33 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>