More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1464 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  72.26 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  66.84 
 
 		 393 aa  569  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  68.11 
 
 		 393 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  64.8 
 
 		 393 aa  552  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  64.89 
 
 		 393 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  61.73 
 
 		 393 aa  522  1e-147  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  41.65 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  41.9 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  39.07 
 
 		 392 aa  296  3e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  40.41 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  40.2 
 
 		 391 aa  292  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  38.42 
 
 		 394 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  38.5 
 
 		 415 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  40.05 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  38.68 
 
 		 394 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  40.41 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  39.04 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  39.95 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  37.82 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.6 
 
 		 404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.93 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  37.22 
 
 		 413 aa  272  8.000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  35.13 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  40.1 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  39.54 
 
 		 389 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  38.65 
 
 		 409 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  34.87 
 
 		 391 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  36.15 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  36.71 
 
 		 400 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  35.37 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  38.5 
 
 		 407 aa  262  6e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  38.5 
 
 		 407 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  39.13 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  37.37 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  35.38 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  36.5 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  37.44 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  38.68 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.83 
 
 		 408 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  36.92 
 
 		 400 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  36.54 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  35.34 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  36.92 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  37.72 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  37.3 
 
 		 391 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  38.02 
 
 		 426 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  38.01 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  34.27 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  37.69 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  35.61 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  35.75 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.2 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  35.37 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  33.76 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.2 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  33.76 
 
 		 397 aa  239  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  36.92 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  36.67 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  35.14 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.73 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  34.92 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  34.46 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  35.11 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  35.5 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  36.67 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  37.76 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  33.93 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  33.93 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  38.28 
 
 		 416 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  33.93 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  34.46 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  34.46 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  34.46 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  34.46 
 
 		 396 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  34.2 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  35.77 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  36.41 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  35.28 
 
 		 388 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.59 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  35.64 
 
 		 398 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  35.38 
 
 		 398 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  34.86 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  34.87 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  33.42 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  33.59 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  35.13 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  35.66 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  33.67 
 
 		 400 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  35.13 
 
 		 398 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  35.34 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  32.91 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  32.83 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>