More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0954 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0954  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
384 aa  776    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1446  hypothetical protein  72.51 
 
 
390 aa  558  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.721087  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  51.17 
 
 
391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  42.23 
 
 
388 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  41.67 
 
 
405 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  43.95 
 
 
392 aa  278  9e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  41.34 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  41.34 
 
 
389 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  40.31 
 
 
389 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  38.9 
 
 
395 aa  259  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  37.27 
 
 
418 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  38.7 
 
 
393 aa  250  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  38.02 
 
 
393 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  40 
 
 
413 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  36.75 
 
 
415 aa  248  9e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  37.69 
 
 
394 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  38.12 
 
 
391 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  37.73 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  40.46 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  39.15 
 
 
394 aa  243  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  37.96 
 
 
394 aa  243  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  35.38 
 
 
389 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  35.71 
 
 
394 aa  239  5e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  36.84 
 
 
391 aa  239  8e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  38.26 
 
 
393 aa  237  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  37.76 
 
 
394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  38.79 
 
 
396 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.05 
 
 
391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  39.12 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  37.2 
 
 
393 aa  233  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  37.17 
 
 
392 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  38.27 
 
 
416 aa  230  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  36.81 
 
 
396 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  36.25 
 
 
390 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  35.37 
 
 
390 aa  228  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  36.05 
 
 
394 aa  226  8e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  38.8 
 
 
397 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  35.16 
 
 
394 aa  223  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  36.99 
 
 
404 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  36.99 
 
 
404 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  37.15 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  36.73 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  36.16 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  37.15 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  37.15 
 
 
404 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  39.33 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  33.51 
 
 
391 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  33.51 
 
 
391 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  37.2 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  36.25 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  35.77 
 
 
397 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  36.25 
 
 
396 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1086  methyltransferase small  33.07 
 
 
388 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  37.93 
 
 
397 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  36.73 
 
 
396 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  37.5 
 
 
398 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  38.52 
 
 
389 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  36 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  37.24 
 
 
404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.48 
 
 
396 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  36.46 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  35.99 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  34.83 
 
 
396 aa  216  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  34.83 
 
 
396 aa  216  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  34.56 
 
 
396 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  35.48 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  36.46 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  37.53 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  36.46 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  36.46 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  35.73 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  35.73 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  35.2 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  33.76 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  37.28 
 
 
400 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  36 
 
 
403 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  37.17 
 
 
400 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  36.96 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.56 
 
 
396 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.52 
 
 
423 aa  212  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  37.92 
 
 
407 aa  212  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  37.53 
 
 
400 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  34.55 
 
 
393 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  37.63 
 
 
397 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  38.18 
 
 
407 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.73 
 
 
403 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.73 
 
 
403 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  34.87 
 
 
425 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  33.76 
 
 
398 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  35.37 
 
 
422 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.73 
 
 
403 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.73 
 
 
403 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  33.92 
 
 
396 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  35.22 
 
 
396 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  33.86 
 
 
395 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  33.78 
 
 
397 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  36.78 
 
 
397 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  37.7 
 
 
395 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  34.96 
 
 
396 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  34.96 
 
 
396 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>