More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2179 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  100 
 
 		 393 aa  818    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  38.11 
 
 		 394 aa  282  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  38.52 
 
 		 411 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  37.07 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  34.84 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  37.73 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  37.04 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  39.68 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  36.24 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  38.06 
 
 		 397 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  36.17 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  35.45 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.3 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  39.95 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  35.79 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  38.67 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  36.44 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  35.79 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  35.45 
 
 		 397 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  36.05 
 
 		 389 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  35.79 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  35.79 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  35.79 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  38.14 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  36.17 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  36.17 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  36.17 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  37.4 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  37.14 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  35.98 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  35.64 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  35.81 
 
 		 415 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  35.64 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  35.9 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  35.64 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.64 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.64 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.64 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.64 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  36.86 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  35.98 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  35.64 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  37.11 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  35.98 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.22 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  37.3 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  38.14 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  38.14 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  38.14 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  36.7 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.51 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  38.42 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  37.04 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.45 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  37.11 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  35.22 
 
 		 425 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  34.99 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  37.33 
 
 		 392 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  34.65 
 
 		 423 aa  242  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  37.56 
 
 		 397 aa  242  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  35.7 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  37.53 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  34.95 
 
 		 413 aa  239  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  34.44 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  35.45 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  36.95 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  35.56 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  33.69 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  34.98 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  34.98 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  34.98 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  34.98 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  34.98 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  33.93 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  37.53 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  36.75 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  34.89 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  34.89 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  38.52 
 
 		 552 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  37.4 
 
 		 395 aa  232  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  37.34 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  34.63 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  35.45 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  34.57 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  36.87 
 
 		 395 aa  229  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  34.57 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  35.47 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  36.6 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.08 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  34.22 
 
 		 413 aa  222  9e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  34.12 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  35.96 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  34.64 
 
 		 397 aa  219  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  33.42 
 
 		 389 aa  219  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>