More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4035 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  100 
 
 		 389 aa  803    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  83.03 
 
 		 389 aa  690    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  83.03 
 
 		 389 aa  689    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  90.11 
 
 		 364 aa  691    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  38.58 
 
 		 552 aa  278  9e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  39.24 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.75 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  37.82 
 
 		 433 aa  255  8e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  36.41 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  33.59 
 
 		 418 aa  248  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  35.45 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.04 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  34.3 
 
 		 411 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  33.86 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  34.04 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  34.04 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.04 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.04 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  36.62 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  36.36 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  34.3 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  34.04 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  34.04 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  34.04 
 
 		 396 aa  242  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  34.04 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.13 
 
 		 408 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  34.04 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  34.04 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  33.77 
 
 		 396 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  34.04 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  36.11 
 
 		 400 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  33.6 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  33.6 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  239  8e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  33.51 
 
 		 397 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  35.09 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  33.42 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  33.42 
 
 		 396 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  34.2 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  34.35 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  34.35 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.22 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  32.29 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  32.45 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  31.66 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  31.93 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  31.93 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  33.59 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  33.25 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  32.53 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  32.23 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 		 404 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  35.11 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  35.66 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 		 404 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.42 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  32.11 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  35.03 
 
 		 393 aa  223  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  31.84 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  32.82 
 
 		 404 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  32.82 
 
 		 404 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  32.82 
 
 		 404 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  34.3 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  35.22 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  32.25 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  33.42 
 
 		 393 aa  219  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  33.25 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  31.45 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  31.37 
 
 		 423 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  31.22 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  32.27 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.21 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  32.63 
 
 		 391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  31.39 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  31.39 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  31.39 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  31.39 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  31.39 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  33.24 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  32.99 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  31.43 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  35.26 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  32.46 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  33.24 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  35.19 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  32.21 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  33.6 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  31.43 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  33.06 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  33.06 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  32.45 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  31.09 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  33.16 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>