More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2571 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  100 
 
 		 413 aa  856    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  59.34 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  47.47 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  39.24 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  40.94 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  41.37 
 
 		 364 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  40.68 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  38.08 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.2 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  36.99 
 
 		 396 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  36.55 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  36.69 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  36.29 
 
 		 396 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  36.76 
 
 		 411 aa  222  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  34.22 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  35.84 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  36.03 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  35.57 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  36.29 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  35.32 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  36.29 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  35.06 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.15 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  34.65 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  36.29 
 
 		 393 aa  216  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  33.59 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  34.81 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  34.81 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  34.65 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  34.81 
 
 		 396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  34.65 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  34.65 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  34.67 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  34.41 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  33.59 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  34.46 
 
 		 396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  33.94 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.94 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  35.35 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.94 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.94 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.94 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  32.78 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.01 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  33.42 
 
 		 391 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  32.55 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.03 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  209  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  33.77 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  33.91 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  32.7 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  34.77 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  34.59 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  32.31 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  32.31 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  32.31 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  32.31 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  32.31 
 
 		 425 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  34.24 
 
 		 367 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  34.24 
 
 		 367 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  34.63 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  36.1 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  32.9 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  33.51 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  35.28 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  33.68 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  33.68 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  36.1 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  34.09 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  38.59 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  33.93 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  33.08 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  33.6 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.44 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.79 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  37.53 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  33.25 
 
 		 416 aa  199  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  32.81 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.16 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  33.08 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  34.69 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  33.25 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  31.41 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  30.71 
 
 		 415 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  35.52 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  32.33 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  31.76 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  31.76 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  31.5 
 
 		 396 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  33.6 
 
 		 418 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  36.51 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  35.68 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  36.51 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>