More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03498 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  90.11 
 
 
389 aa  691    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  100 
 
 
364 aa  747    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  82.14 
 
 
389 aa  634  1e-180  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  81.87 
 
 
389 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  42.33 
 
 
552 aa  280  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  41.37 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  40.62 
 
 
433 aa  252  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.95 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  35.71 
 
 
411 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  34.77 
 
 
396 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  34.77 
 
 
396 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  34.77 
 
 
396 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  34.77 
 
 
396 aa  242  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  34.77 
 
 
391 aa  242  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  35.07 
 
 
367 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  35.07 
 
 
367 aa  242  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  33.42 
 
 
396 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  35.48 
 
 
403 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  36.49 
 
 
396 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  34.77 
 
 
396 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  35.16 
 
 
397 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  34.32 
 
 
418 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  35.34 
 
 
396 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  34.5 
 
 
396 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.22 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.22 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.22 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.22 
 
 
403 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  34.85 
 
 
397 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.59 
 
 
395 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  35.16 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  35.16 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  35.26 
 
 
396 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  35.26 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  35.26 
 
 
396 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  35.26 
 
 
396 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  35.26 
 
 
396 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  34.05 
 
 
396 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  33.78 
 
 
397 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  34.89 
 
 
396 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  34.45 
 
 
392 aa  223  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 
396 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  32.53 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  32.53 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  32.26 
 
 
396 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  33.96 
 
 
397 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  35.13 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  36.93 
 
 
393 aa  219  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  35.29 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  33.8 
 
 
397 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  35.03 
 
 
400 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  35.93 
 
 
418 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  35.05 
 
 
408 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  33.51 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  35.03 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.22 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  33.98 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  32.23 
 
 
397 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  34.52 
 
 
396 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  35.5 
 
 
392 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  35.8 
 
 
393 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.16 
 
 
397 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  31.27 
 
 
394 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  32.63 
 
 
400 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  33.42 
 
 
397 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  32.63 
 
 
400 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  32.1 
 
 
400 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  34.09 
 
 
394 aa  206  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  31.44 
 
 
389 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  32.9 
 
 
404 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  32.8 
 
 
400 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  35.03 
 
 
395 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.06 
 
 
394 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  33.52 
 
 
390 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2179  methyltransferase small  32.7 
 
 
393 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.41478  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  32.64 
 
 
404 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  32.64 
 
 
404 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  32.64 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  32.38 
 
 
404 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  32.38 
 
 
404 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  32.38 
 
 
404 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  33.7 
 
 
391 aa  199  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  32.88 
 
 
396 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  30.96 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  33.15 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  33.7 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  33.52 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  36.67 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  33.24 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  35.57 
 
 
402 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  33.24 
 
 
391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  32.78 
 
 
396 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  35.81 
 
 
394 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  32.39 
 
 
394 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  36.14 
 
 
397 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  35.01 
 
 
391 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  34.37 
 
 
493 aa  193  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  29.82 
 
 
422 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  30.1 
 
 
425 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  30.17 
 
 
423 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>