More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0390 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  82.12 
 
 
400 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  99.29 
 
 
425 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  98.59 
 
 
422 aa  797    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  99.53 
 
 
425 aa  855    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  99.29 
 
 
425 aa  854    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 
425 aa  857    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  86.79 
 
 
404 aa  733    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  87.26 
 
 
404 aa  735    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  87.26 
 
 
404 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  93.41 
 
 
423 aa  786    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  80.24 
 
 
400 aa  674    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  99.29 
 
 
425 aa  854    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  87.26 
 
 
404 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  99.29 
 
 
425 aa  854    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  86.08 
 
 
404 aa  725    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  87.26 
 
 
404 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  80.71 
 
 
400 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  87.26 
 
 
404 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  73.41 
 
 
397 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  72.64 
 
 
400 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  72.17 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  67.14 
 
 
398 aa  581  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  66.67 
 
 
397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  56.44 
 
 
396 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  51.99 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  54.46 
 
 
397 aa  414  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  53.74 
 
 
397 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  51.29 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  46.23 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  48.47 
 
 
397 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  53.43 
 
 
395 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  49.11 
 
 
422 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  46.34 
 
 
395 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  46.59 
 
 
418 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  46.35 
 
 
397 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  47.62 
 
 
396 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  47.38 
 
 
396 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  47.38 
 
 
396 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  47.28 
 
 
396 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  46.59 
 
 
411 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  47.38 
 
 
396 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  46.12 
 
 
397 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  47.38 
 
 
396 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  50.7 
 
 
395 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  46.81 
 
 
396 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  46.81 
 
 
396 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  45.99 
 
 
397 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  46.57 
 
 
396 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  50.94 
 
 
395 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  46.57 
 
 
396 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  43.68 
 
 
396 aa  378  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  50 
 
 
393 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  46.46 
 
 
397 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  43.88 
 
 
391 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  43.68 
 
 
396 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  43.68 
 
 
396 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  43.68 
 
 
396 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  42.12 
 
 
394 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  43.68 
 
 
396 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  43.68 
 
 
396 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  43.2 
 
 
396 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  42.55 
 
 
403 aa  362  9e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  42.55 
 
 
403 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  42.55 
 
 
403 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  42.55 
 
 
403 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  42.55 
 
 
403 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  43.03 
 
 
396 aa  361  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  42.08 
 
 
396 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  42.24 
 
 
396 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  42.24 
 
 
396 aa  359  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  43.22 
 
 
396 aa  355  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  44.13 
 
 
394 aa  354  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  48.66 
 
 
400 aa  350  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  42.45 
 
 
396 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0903  SAM-dependent methyltransferase  50 
 
 
406 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  43.15 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  43.15 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4090  PUA domain-containing protein  43.22 
 
 
396 aa  330  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.372554 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  38.35 
 
 
415 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  41.57 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  39.67 
 
 
395 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  39.76 
 
 
394 aa  296  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  40.47 
 
 
394 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  38.03 
 
 
390 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2323  methyltransferase small  42.13 
 
 
400 aa  286  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.475171  hitchhiker  0.00560103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  36.32 
 
 
391 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  36.12 
 
 
389 aa  279  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  37.95 
 
 
391 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  36.56 
 
 
418 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  37.08 
 
 
391 aa  273  6e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  41.36 
 
 
408 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  37.47 
 
 
391 aa  270  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  38.66 
 
 
401 aa  263  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  36.52 
 
 
391 aa  260  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  39.08 
 
 
400 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  38.83 
 
 
400 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  38.83 
 
 
400 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  38 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  37.24 
 
 
393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  41.47 
 
 
400 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>