More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1662 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  100 
 
 		 392 aa  807    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  56.96 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  54.55 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  51.93 
 
 		 391 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  42.82 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  43.59 
 
 		 389 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  41.3 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  44.79 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  40.41 
 
 		 415 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  43.11 
 
 		 390 aa  322  8e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  45.13 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  42.56 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  42.16 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  39.74 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  42.49 
 
 		 413 aa  309  4e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  42.17 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  40.87 
 
 		 393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  40.87 
 
 		 394 aa  303  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  39.85 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  39.07 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  41.86 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  37.69 
 
 		 394 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  38.72 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  36.86 
 
 		 391 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  36.86 
 
 		 391 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  41.09 
 
 		 398 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  43.26 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  42.48 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  40.82 
 
 		 409 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  43.01 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  42.12 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  40.1 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  37.79 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  42.53 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  40.05 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  39.79 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  39.79 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  39.85 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  37.82 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  39.53 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  37.44 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  39.69 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.1 
 
 		 404 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  38.44 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  37.18 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  40.05 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  38.82 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  40.2 
 
 		 416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  37.44 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.93 
 
 		 394 aa  270  5e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  37.98 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  38.82 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  37.4 
 
 		 396 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  38.82 
 
 		 398 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  37.18 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  36.29 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  38.44 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  37.6 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  36.29 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  34.95 
 
 		 397 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  36.04 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  39.12 
 
 		 426 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  37.4 
 
 		 396 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  37.4 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  37.4 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  37.4 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  36.55 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  40.46 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  37.6 
 
 		 411 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  36.29 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  37.31 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  37.69 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  36.29 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  36.29 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  39.68 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  36.04 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  38.82 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  39.41 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  36.15 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  39.74 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  35.43 
 
 		 391 aa  259  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  36.04 
 
 		 397 aa  258  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  36.39 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  35.43 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  36.39 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  36.39 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  36.39 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  36.04 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  36.39 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.27 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  38.87 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  34.88 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  40 
 
 		 400 aa  255  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  36.48 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  34.96 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  37.6 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  36.68 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  37.86 
 
 		 400 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>