More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1771 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  783    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1304  SAM-dependent methyltransferase  69.72 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.730184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2647  SAM-dependent methyltransferase  69.97 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2689  SAM-dependent methyltransferase  65.91 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1954  SAM-dependent methyltransferase  67.01 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1183  putative RNA methylase  68.86 
 
 		 427 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.414629  normal  0.94846 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0887  SAM-dependent methyltransferase  66.75 
 
 		 405 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324188  normal  0.483591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  45.2 
 
 		 416 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  42.14 
 
 		 407 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  42.14 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2968  SAM-dependent methyltransferase  40.46 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  39.9 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  39.09 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  39.9 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  38.11 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  38.32 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  40.4 
 
 		 404 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  37.6 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  39.09 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  38.07 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  40.1 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  39.34 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  42.34 
 
 		 398 aa  258  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  37.82 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  37.82 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  37.56 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  37.56 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  36.25 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  38.18 
 
 		 396 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  39.18 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  37.85 
 
 		 394 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2043  protein of unknown function Met10  40.76 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.338836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  37.53 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  37.28 
 
 		 404 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  36.18 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  36.6 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  37.31 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  37 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  37.28 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  37.78 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  37.28 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  37.28 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  33.93 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  36.29 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  36.54 
 
 		 404 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  31.17 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  37 
 
 		 400 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  36.66 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  31.17 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  36 
 
 		 425 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  36.9 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  35.78 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  36.5 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  35.31 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  36.24 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  36.24 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  36.24 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  36.24 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.46 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  36.86 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  36 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  36.57 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  35.77 
 
 		 397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  34.69 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  35.53 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  36.78 
 
 		 397 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.55 
 
 		 392 aa  212  7.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  31.69 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  31.13 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  39.47 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  35.25 
 
 		 400 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  33.25 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  36.15 
 
 		 552 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  34.77 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  37.17 
 
 		 396 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  38.83 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  34.94 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  32.56 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3851  protein of unknown function Met10  36.6 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.848902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  38.4 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  36.15 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  34.92 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  32.14 
 
 		 392 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  37.24 
 
 		 389 aa  196  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  34.5 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  38.14 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  38.14 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  33.92 
 
 		 401 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  33.42 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  33.42 
 
 		 391 aa  193  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  33.5 
 
 		 397 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  36.73 
 
 		 395 aa  193  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 		 395 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  32.47 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  29.02 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.9 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  34.55 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>