More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3930 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  100 
 
 		 479 aa  981    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  37.68 
 
 		 400 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  37.68 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  37.44 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  37.67 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  36.79 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  33.18 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  33.66 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  31.43 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  31.77 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  31.74 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  33.8 
 
 		 403 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  35.58 
 
 		 396 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  30.79 
 
 		 394 aa  204  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  31.77 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  30.79 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  30.69 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  32.94 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  31.16 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  31.28 
 
 		 393 aa  199  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  31.57 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  31.57 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  31.57 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  30.29 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  33.57 
 
 		 395 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  33.41 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  31.33 
 
 		 396 aa  196  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.48 
 
 		 391 aa  196  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  31.08 
 
 		 396 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  31.08 
 
 		 396 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  33.89 
 
 		 400 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  29.78 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  32.78 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  32.78 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  32.78 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  32.22 
 
 		 404 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  30.9 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  28.85 
 
 		 389 aa  193  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  32.38 
 
 		 404 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  32.3 
 
 		 404 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  32.2 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  32.39 
 
 		 418 aa  192  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  29.81 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  33.98 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  30.81 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  33.49 
 
 		 400 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  191  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  32.54 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  31.97 
 
 		 397 aa  190  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  33.89 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  28.4 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  30.05 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  33.65 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  32.13 
 
 		 400 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  30.02 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  30.02 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  30.02 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  30.02 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  30.02 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  30.19 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  30.36 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  30.97 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  32.04 
 
 		 397 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  28.4 
 
 		 391 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  32.69 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  33.25 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  31.8 
 
 		 398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  31.25 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  31.19 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  34.21 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  29.71 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30.77 
 
 		 399 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  30.55 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  30.55 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  32.37 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  30.55 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  30.55 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  34.13 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  33.5 
 
 		 400 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  29.23 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  29.23 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  29.23 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  33.91 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  30.55 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  31.15 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  30.65 
 
 		 367 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  29.95 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  30.65 
 
 		 367 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  32.37 
 
 		 398 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  30.84 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  29.74 
 
 		 411 aa  179  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  31.74 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  29.95 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  29.23 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  26.81 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  27.88 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  29.95 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  34.51 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>