More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3385 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  100 
 
 		 412 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  44.01 
 
 		 408 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  42.4 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  42.4 
 
 		 400 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  42.16 
 
 		 400 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  37.98 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  37.31 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  39.3 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  36.54 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  38.44 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  36.09 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  36.16 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  32.58 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  34.06 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 		 404 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  35.89 
 
 		 392 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 404 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  36.39 
 
 		 404 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  37.47 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  35.1 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  36.22 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  36.47 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  33.76 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  37.47 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  31.68 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  32.35 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  32.41 
 
 		 394 aa  210  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  34.92 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  32.65 
 
 		 396 aa  209  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  34.33 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  34.44 
 
 		 396 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  32.61 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  36.5 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  35.07 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  32.11 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  33.82 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  38.31 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  31.46 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  32.49 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  32.49 
 
 		 396 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  35.38 
 
 		 425 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  32.65 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  39.1 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  32.65 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  32.65 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.83 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.83 
 
 		 396 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.83 
 
 		 391 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.74 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.74 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  35.63 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  35.61 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  35.61 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  35.61 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  35.61 
 
 		 425 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  33.84 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  31.86 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  36.72 
 
 		 397 aa  203  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.71 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  35.61 
 
 		 425 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  34.5 
 
 		 422 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  35.47 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  32.39 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  35.07 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  33.59 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  33.59 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3862  protein of unknown function Met10  38.56 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  33.59 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  34.73 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  34.42 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  33.59 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  33.17 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  32.41 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  30.22 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4768  SAM-dependent methyltransferase  34.47 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000059274  normal  0.0101611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  34.92 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  34.55 
 
 		 396 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3779  protein of unknown function Met10  38.31 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  33.5 
 
 		 393 aa  199  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  35.38 
 
 		 401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  37.31 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  31.99 
 
 		 411 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  36 
 
 		 397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  34.92 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3722  SAM-dependent methyltransferase  38.06 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  31.06 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  32.23 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  32.08 
 
 		 394 aa  196  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  36.66 
 
 		 397 aa  196  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  35.98 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  30.25 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  31.06 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  31.97 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  31.85 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  31.97 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  31.97 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  31.97 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  30.81 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>