More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11313 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  841    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  38.25 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  34.43 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  33.85 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  33.85 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  33.85 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.66 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  32.39 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  32.99 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.43 
 
 		 479 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  31.43 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  33.17 
 
 		 393 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  33.58 
 
 		 395 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  31.36 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  31.88 
 
 		 393 aa  209  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  33.68 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  32.04 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  31.43 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  31.03 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  31.27 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  31.54 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  32.25 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  33.16 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  29.2 
 
 		 402 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  34.53 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  32.25 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  32.59 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  32.17 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  31.49 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  31.73 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  32.25 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  33.58 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  32.32 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  32.32 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  33.33 
 
 		 394 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  30.22 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  30.85 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0282  SAM-dependent methyltransferase  29.69 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  30.6 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  32.07 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  32.07 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  32.07 
 
 		 396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  32.58 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  30.77 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  30.03 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  29.43 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  29.77 
 
 		 404 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  29.04 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  31.95 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  29.77 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  29.52 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  29.26 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  29.52 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  29.52 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  31.59 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  30.35 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  30.63 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  30.3 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  30.41 
 
 		 400 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  29.49 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  30.1 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  30.56 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  31.16 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  30.1 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  32.12 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  29.78 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  30.38 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  29.74 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  29.85 
 
 		 398 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  30.58 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  30.3 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  31.77 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  31.65 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  31.49 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  29.29 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  29.85 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  31.23 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  29.63 
 
 		 552 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  31.87 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  30.48 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  30.83 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  31.59 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  29.35 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  28.4 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  29.35 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  28.19 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  30.94 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  30.05 
 
 		 390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  28.33 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  30.47 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  30.12 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.26 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  31.08 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2247  hypothetical protein  30.07 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  31.66 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  28.78 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  31.78 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3058  PUA domain containing protein  32.19 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0617  methyltransferase related protein  30.05 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  30.75 
 
 		 397 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>