181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0253 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  100 
 
 		 360 aa  729    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  45.54 
 
 		 350 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  45.09 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  44.84 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  40.38 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  36.61 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0171  putative RNA methylase  34.41 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  hitchhiker  0.00204483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  28.87 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  26.63 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  30.89 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  24.92 
 
 		 379 aa  86.3  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  30.65 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  27.27 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  27.21 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  30.68 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  26.84 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  27.31 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.91 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  30.56 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  29.55 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  35.16 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  34.29 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.24 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  41.1 
 
 		 210 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  31.62 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  25.22 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1845  methyltransferase small  34.4 
 
 		 203 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 		 257 aa  53.5  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 283 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 251 aa  52.8  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0566  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.57 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0178303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  31.3 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0447  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.38 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.389747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  30.97 
 
 		 250 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  30.88 
 
 		 161 aa  50.1  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  33.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  35.85 
 
 		 283 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 248 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3214  methyltransferase of 50S ribosomal subunit protein L11  31.37 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  29.7 
 
 		 250 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  35.58 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1287  modification methylase, HemK family  37.08 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  38.1 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.03 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  40.58 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.57 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1237  modification methylase, HemK family  29.14 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  34.78 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4113  putative RNA methylase  28.89 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.75 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 360 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  30.21 
 
 		 241 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  28.81 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  27.94 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.5 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  32.94 
 
 		 414 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0236  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.92387  normal  0.953323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.75 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3050  methyltransferase type 12  31.88 
 
 		 224 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.5 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2178  methyltransferase small  34.94 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.599131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  26.26 
 
 		 245 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.23 
 
 		 277 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  32.35 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.5 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.5 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0202  methyltransferase small  32.26 
 
 		 213 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.5 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  27.34 
 
 		 317 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  37.97 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  31.94 
 
 		 165 aa  46.6  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  39.22 
 
 		 206 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  34.29 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.96 
 
 		 251 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09930  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.07 
 
 		 312 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 263 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  39.29 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  32.1 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.29 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  26.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0422  HemK family modification methylase  36.9 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.81 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  25.32 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  34.95 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6147  modification methylase, HemK family  28.77 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.324026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 261 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  35.94 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  31.01 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>