More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1430 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  44.98 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  46.3 
 
 		 278 aa  224  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  46.5 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  42.24 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.49 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0822  HemK family modification methylase  37.83 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.21973  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1284  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0745  HemK family modification methylase  37.83 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.150019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  40.23 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  36.76 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.86 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  36.36 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.03 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.81 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  36.15 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  36.15 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  33.67 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  35.66 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  37 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  38.34 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.56 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  35.89 
 
 		 277 aa  135  9e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  39.9 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  33.21 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  41.7 
 
 		 270 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  37.96 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  34.85 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  37.36 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  39.71 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  40.91 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  33.83 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1421  HemK family modification methylase  34.7 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0749193  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.86 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  34.17 
 
 		 587 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  41.03 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  33.81 
 
 		 587 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  34.72 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  36.65 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  34.78 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  32.73 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  30.55 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  34.62 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  35.88 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  33.59 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  36.09 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  37.78 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  32.17 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  33.58 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.69 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  39.52 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.43 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  35.77 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.99 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.78 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  35.32 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  33.46 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  34.69 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.82 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.08 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.71 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.95 
 
 		 297 aa  121  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  32.5 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1627  modification methylase, HemK family  33.11 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.38 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4634  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.86 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  34.78 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.88 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  34.18 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  34.73 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  35.29 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  37.66 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  34.26 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.32 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  32.46 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  38.46 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  32.62 
 
 		 288 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  39.01 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.72 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.67 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.13 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  33.78 
 
 		 289 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  37.1 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1863  HemK family modification methylase  36.16 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  36.94 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  39.62 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.44 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0806  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.405188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  32.2 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  30.8 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  35.06 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2918  modification methylase, HemK family  32.49 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  37.85 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.94 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  32.7 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.18 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  32.97 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.18 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  27.59 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>