More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0166 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  100 
 
 
291 aa  565  1e-160  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  37.95 
 
 
302 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  42.01 
 
 
279 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  40.89 
 
 
288 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  36.68 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.39 
 
 
285 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  36.97 
 
 
361 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  34.83 
 
 
289 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.61 
 
 
297 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  31.82 
 
 
295 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  37.19 
 
 
587 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30.99 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  36.49 
 
 
587 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  32.86 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.94 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  31.94 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  32.75 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  31.58 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  30.77 
 
 
283 aa  162  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  32.38 
 
 
284 aa  162  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.94 
 
 
287 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  34.62 
 
 
283 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  36.29 
 
 
262 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  33.81 
 
 
284 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.87 
 
 
321 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1094  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.22 
 
 
277 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.747327  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.1 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.21 
 
 
284 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  34.98 
 
 
288 aa  155  9e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.5 
 
 
296 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  30.31 
 
 
289 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.87 
 
 
283 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  32.52 
 
 
283 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.22 
 
 
283 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  32.16 
 
 
277 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1421  HemK family modification methylase  38.35 
 
 
261 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0749193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  32.47 
 
 
288 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  31.8 
 
 
277 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  33.08 
 
 
285 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  34.18 
 
 
287 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  29.23 
 
 
284 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.92 
 
 
287 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  31.82 
 
 
283 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  31.96 
 
 
296 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  31.82 
 
 
283 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  34.18 
 
 
287 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.82 
 
 
283 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  46.43 
 
 
262 aa  149  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  30.55 
 
 
285 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.82 
 
 
283 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  32.17 
 
 
283 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  29.02 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  28.01 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  31.82 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  31.06 
 
 
306 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  31.47 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  30.71 
 
 
289 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  30.91 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.78 
 
 
281 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  37.77 
 
 
258 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.33 
 
 
300 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  33.69 
 
 
276 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  30.18 
 
 
300 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  28.62 
 
 
279 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  27.97 
 
 
279 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.53 
 
 
285 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  31.95 
 
 
287 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  28.99 
 
 
274 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.62 
 
 
283 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.46 
 
 
280 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  31.82 
 
 
286 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  31.45 
 
 
283 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.33 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  30.28 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  30.86 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  29.2 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  28.77 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  31.03 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  30.82 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.42 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  30.83 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.69 
 
 
280 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 
287 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  30.32 
 
 
280 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.11 
 
 
276 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.52 
 
 
276 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  31.06 
 
 
280 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.06 
 
 
280 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  28.52 
 
 
285 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  31.06 
 
 
280 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  36.59 
 
 
261 aa  140  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  30.53 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.6 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  30.39 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.64 
 
 
283 aa  139  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.76 
 
 
276 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.03 
 
 
286 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  33.94 
 
 
280 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  30.32 
 
 
280 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.87 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>