More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0895 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  100 
 
 
258 aa  508  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1421  HemK family modification methylase  54.47 
 
 
261 aa  267  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0749193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0447  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.23 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0432  HemK family modification methylase  51.23 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.77 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1673  HemK family modification methylase  35.98 
 
 
268 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0452249  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  35.32 
 
 
300 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.32 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  34.78 
 
 
283 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  34.78 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  34.78 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.14 
 
 
283 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.06 
 
 
283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  34.78 
 
 
283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.78 
 
 
283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0806  modification methylase, HemK family  43.33 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.405188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  34.78 
 
 
283 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.06 
 
 
283 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  35.19 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  38.11 
 
 
285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0569  modification methylase, HemK family  30.88 
 
 
267 aa  132  5e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  33.7 
 
 
283 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  36.02 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  34.05 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  32.7 
 
 
282 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1284  HemK family modification methylase  34.67 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  35.61 
 
 
587 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  35.25 
 
 
587 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0745  HemK family modification methylase  33.78 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.150019  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0543  bifunctional methyltransferase  34.85 
 
 
261 aa  126  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  33.1 
 
 
285 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  34.08 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  33.21 
 
 
302 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  34.66 
 
 
274 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  32.85 
 
 
289 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0129  modification methylase HemK family  34.98 
 
 
307 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  35.6 
 
 
287 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  31.45 
 
 
280 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  34.78 
 
 
280 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  34.69 
 
 
273 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.49 
 
 
293 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0822  HemK family modification methylase  31.45 
 
 
271 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.21973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2379  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.32 
 
 
288 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2759  modification methylase, HemK family  35.32 
 
 
288 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  36.99 
 
 
270 aa  121  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  33.72 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  40.28 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  31.14 
 
 
278 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  33.33 
 
 
310 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  30.98 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  36.47 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  35.24 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  38.26 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  32.43 
 
 
289 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  35.55 
 
 
276 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  37.32 
 
 
359 aa  116  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  31.5 
 
 
304 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  37.39 
 
 
271 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  31.05 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1319  modification methylase HemK  33.9 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.725902  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  31.05 
 
 
278 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  32.01 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  34.45 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  33.07 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  30.71 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  32.85 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.86 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2529  HemK family modification methylase  32.8 
 
 
274 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.677433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.4 
 
 
289 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.02 
 
 
281 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  31.27 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.46 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  39.9 
 
 
361 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  33.46 
 
 
283 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.64 
 
 
275 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  34.65 
 
 
280 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  34.13 
 
 
293 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  32.42 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  34.29 
 
 
278 aa  111  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  30.65 
 
 
285 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  29.85 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  32.71 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.76 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.74 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30.86 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  30.59 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.33 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  33.08 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0042  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.61 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  36.2 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0811  cyclic nucleotide-binding protein  33.2 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.350613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  35.19 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1660  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.33 
 
 
287 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  30.56 
 
 
281 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  32.48 
 
 
275 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  38.33 
 
 
277 aa  108  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  38.65 
 
 
284 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.51 
 
 
280 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  33.33 
 
 
295 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>