97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0722 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  100 
 
 
334 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  61.2 
 
 
371 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  60.27 
 
 
365 aa  363  2e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  61.7 
 
 
343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  59.44 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  36.39 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  35.55 
 
 
344 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  37.37 
 
 
318 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  34.24 
 
 
346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  37.84 
 
 
317 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  29.88 
 
 
317 aa  134  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  32.66 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.21 
 
 
351 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  28.11 
 
 
364 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  28.21 
 
 
350 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  25.98 
 
 
350 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  29.17 
 
 
367 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  39.53 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.88 
 
 
310 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  36.13 
 
 
374 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  29.48 
 
 
314 aa  89  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  22.96 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  29.83 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  29.83 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  29.8 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  29.8 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  29.8 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  30.6 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  29.83 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  29.83 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  29.83 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  29.28 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  30.34 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  33.33 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  26.15 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  33.09 
 
 
224 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
266 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  29.71 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  37.37 
 
 
224 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  28.89 
 
 
336 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  30.99 
 
 
430 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  34.52 
 
 
461 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  24.16 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  27.86 
 
 
469 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  33.33 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.94 
 
 
947 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  29.41 
 
 
437 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  26.07 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  26.77 
 
 
591 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  36.99 
 
 
495 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  33.33 
 
 
227 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  39.39 
 
 
200 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  30.2 
 
 
349 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  29.03 
 
 
350 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  32.76 
 
 
260 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
234 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  39.74 
 
 
266 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
268 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  32.08 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  32.35 
 
 
499 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.33 
 
 
442 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  30.69 
 
 
362 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1491  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.96 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0153507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.93 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  30.68 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.33 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  31.37 
 
 
499 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  33.75 
 
 
210 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.79 
 
 
449 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10450  RNA methylase family UPF0020 protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12140)  26.72 
 
 
499 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  28.57 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  31 
 
 
492 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  37.35 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  30.93 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 
259 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2428  hypothetical protein  26.05 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.939797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  28.03 
 
 
463 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.43 
 
 
260 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1048  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.79 
 
 
455 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366869  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0552  methyltransferase small  29.85 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50 
 
 
706 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50 
 
 
706 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  32.47 
 
 
508 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  32.47 
 
 
523 aa  43.1  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  50 
 
 
706 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
270 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
259 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.01 
 
 
449 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30 
 
 
225 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  35.44 
 
 
226 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0680  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
239 aa  42.7  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
235 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00740  hypothetical protein  29.73 
 
 
475 aa  42.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.635907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>