112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3798 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  100 
 
 		 495 aa  1017    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.73 
 
 		 947 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  27.84 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  29.04 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  26.36 
 
 		 463 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  25.94 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  22.86 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  25.41 
 
 		 483 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  27.3 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  24.05 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  24.04 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  28.04 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  25.31 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.51 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  22.28 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  24.18 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  26.72 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  24.18 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  25.48 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  44.32 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  42.65 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  26.81 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  27.97 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  23.95 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  22.06 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  24.4 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  22.83 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  22.22 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  42.42 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  26.07 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.36 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.03 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  35.71 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  21.04 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  22.73 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.6 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.02 
 
 		 528 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.47 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  38.33 
 
 		 310 aa  53.5  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  24.51 
 
 		 374 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.69 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  35.23 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.86 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  36.99 
 
 		 334 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.89 
 
 		 488 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  22.8 
 
 		 472 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  35.14 
 
 		 317 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  40.91 
 
 		 346 aa  50.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  36.99 
 
 		 407 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  28.03 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  23.32 
 
 		 877 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  35 
 
 		 421 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  35.85 
 
 		 317 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  30.12 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.47 
 
 		 739 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  37.88 
 
 		 894 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  44.07 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  37.21 
 
 		 283 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  37.21 
 
 		 283 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.21 
 
 		 283 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.21 
 
 		 283 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  40 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.91 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  28.12 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  41.27 
 
 		 259 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  40.32 
 
 		 540 aa  47.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46 
 
 		 368 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.93 
 
 		 251 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.08 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  29.17 
 
 		 146 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  23.94 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  23.94 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  37.68 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  30.47 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  20.37 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.08 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  37.08 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.08 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.08 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  43.86 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  37.08 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  37.08 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  37.08 
 
 		 282 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.25 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  33.82 
 
 		 892 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  36.36 
 
 		 259 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.05 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  38.71 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  43.75 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  56.1 
 
 		 369 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  38.16 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  38.16 
 
 		 284 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.05 
 
 		 283 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.05 
 
 		 283 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  38.16 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  38.16 
 
 		 317 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  45 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  23.4 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  31.37 
 
 		 792 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>