55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5156 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  25.49 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.66 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  25.07 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  21.91 
 
 
393 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  24.46 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  24.51 
 
 
482 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  40 
 
 
259 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.33 
 
 
947 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  23.85 
 
 
445 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  22.73 
 
 
495 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.11 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  33.73 
 
 
259 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  27.12 
 
 
438 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  38.1 
 
 
483 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  21.77 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.68 
 
 
737 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  22.76 
 
 
430 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.72 
 
 
524 aa  50.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  22.36 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  34.26 
 
 
747 aa  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  29.76 
 
 
877 aa  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.87 
 
 
633 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.06 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
412 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  32.86 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  21.68 
 
 
438 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  40.74 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.29 
 
 
528 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  38.1 
 
 
535 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  39.68 
 
 
476 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  38.18 
 
 
322 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.76 
 
 
371 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  31.03 
 
 
463 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  22.18 
 
 
433 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  31.75 
 
 
530 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  24.58 
 
 
433 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  38.89 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  40.32 
 
 
792 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.11 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.86 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  41.33 
 
 
920 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  42.31 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  32.81 
 
 
614 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  29.33 
 
 
450 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  22.67 
 
 
421 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  22.91 
 
 
439 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  29.66 
 
 
703 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  22.91 
 
 
439 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.18 
 
 
412 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  39.22 
 
 
380 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  38.71 
 
 
933 aa  43.1  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.38 
 
 
391 aa  43.1  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>