79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1791 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  100 
 
 		 703 aa  1369    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  47.95 
 
 		 651 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  29.45 
 
 		 878 aa  264  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  26.39 
 
 		 916 aa  248  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  28.99 
 
 		 892 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  29.93 
 
 		 894 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  30.82 
 
 		 731 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  31.69 
 
 		 747 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  28.62 
 
 		 746 aa  220  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  31.22 
 
 		 737 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  30.52 
 
 		 751 aa  206  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  44.08 
 
 		 256 aa  173  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1003 aa  122  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  26.62 
 
 		 996 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  25.73 
 
 		 982 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1118 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1071 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  26.68 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1045 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.51 
 
 		 936 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1070 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.23 
 
 		 934 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1106 aa  101  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1279 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  26.28 
 
 		 947 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1001 aa  90.9  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  26.74 
 
 		 967 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  23.99 
 
 		 906 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.11 
 
 		 979 aa  78.2  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1008 aa  75.1  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  26.03 
 
 		 792 aa  73.9  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  26.34 
 
 		 599 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  22.08 
 
 		 961 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  22.74 
 
 		 964 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1001 aa  68.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  21.77 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  37.66 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.22 
 
 		 979 aa  68.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  24.77 
 
 		 972 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  24.52 
 
 		 540 aa  66.6  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  25.05 
 
 		 933 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  22.33 
 
 		 937 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  22.76 
 
 		 968 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  27.66 
 
 		 920 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  23.63 
 
 		 848 aa  61.2  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  26.17 
 
 		 911 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.17 
 
 		 911 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  23.55 
 
 		 968 aa  60.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.05 
 
 		 739 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.16 
 
 		 1068 aa  58.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  24.76 
 
 		 951 aa  58.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  23.25 
 
 		 933 aa  57.8  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  30.36 
 
 		 1003 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  26.44 
 
 		 992 aa  55.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 		 414 aa  54.7  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1030 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  25.49 
 
 		 960 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  23.74 
 
 		 596 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  21.16 
 
 		 852 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  25.86 
 
 		 965 aa  51.2  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  22.78 
 
 		 947 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  53.66 
 
 		 433 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1012 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  39.34 
 
 		 393 aa  48.5  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  25.94 
 
 		 969 aa  47.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  32 
 
 		 438 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  32.76 
 
 		 530 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  25.67 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  50 
 
 		 535 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  52.08 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.08 
 
 		 599 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.58 
 
 		 524 aa  45.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  30.77 
 
 		 450 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  27.52 
 
 		 969 aa  44.3  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.5 
 
 		 528 aa  44.3  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  44.44 
 
 		 475 aa  44.3  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  64 
 
 		 455 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  25 
 
 		 920 aa  44.3  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  25 
 
 		 920 aa  44.3  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>