81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1717 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
739 aa  1524    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2567  hypothetical protein  52.29 
 
 
307 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0379041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  25.83 
 
 
540 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  26.73 
 
 
596 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1964  hypothetical protein  43.94 
 
 
320 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.222418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  25.83 
 
 
501 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  27.27 
 
 
920 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  27.27 
 
 
920 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  29.35 
 
 
852 aa  82  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  33.77 
 
 
1030 aa  82  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.45 
 
 
1068 aa  79.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  27.42 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  26.25 
 
 
463 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  29.55 
 
 
947 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.69 
 
 
947 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  28.65 
 
 
992 aa  67.4  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  26.34 
 
 
599 aa  65.1  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.57 
 
 
1071 aa  64.7  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  26.67 
 
 
1118 aa  64.3  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  27.39 
 
 
1045 aa  61.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  26.32 
 
 
911 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.32 
 
 
911 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.53 
 
 
414 aa  60.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  35.56 
 
 
916 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.7 
 
 
383 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  32.56 
 
 
731 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  22.74 
 
 
410 aa  59.3  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.73 
 
 
703 aa  58.9  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  21.77 
 
 
438 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  24.55 
 
 
1070 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  30.43 
 
 
934 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  27.97 
 
 
374 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  29.89 
 
 
936 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  46.55 
 
 
878 aa  54.3  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  30.56 
 
 
483 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  25.4 
 
 
894 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  23.95 
 
 
996 aa  52  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.51 
 
 
633 aa  52  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  42.11 
 
 
530 aa  50.8  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  22.68 
 
 
982 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  29.23 
 
 
407 aa  50.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  23.47 
 
 
495 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.03 
 
 
418 aa  48.9  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.75 
 
 
419 aa  48.5  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.4 
 
 
391 aa  48.1  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  53.85 
 
 
334 aa  47.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  33.72 
 
 
414 aa  47.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  30.49 
 
 
146 aa  47.8  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  29.9 
 
 
225 aa  47.8  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46 
 
 
421 aa  47.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  54.76 
 
 
259 aa  47  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
315 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1282  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  54.05 
 
 
271 aa  47.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0717608  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.93 
 
 
372 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  21.59 
 
 
453 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  31.13 
 
 
413 aa  46.2  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  40.74 
 
 
470 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.73 
 
 
651 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  23.43 
 
 
461 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.66 
 
 
372 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  28.87 
 
 
227 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.23 
 
 
293 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  21.43 
 
 
746 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  19.71 
 
 
464 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  40.91 
 
 
481 aa  45.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  31.94 
 
 
227 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  55.26 
 
 
849 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  31.94 
 
 
227 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.22 
 
 
528 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  22.36 
 
 
393 aa  45.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  34.15 
 
 
259 aa  45.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  21.98 
 
 
393 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  37.29 
 
 
329 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.51 
 
 
464 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  31.94 
 
 
227 aa  44.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  24.66 
 
 
433 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.73 
 
 
425 aa  44.3  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
255 aa  44.3  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.72 
 
 
344 aa  44.3  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.109552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.67 
 
 
460 aa  43.9  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  36.99 
 
 
751 aa  43.9  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>