64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5892 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 911 aa  1857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  100 
 
 		 911 aa  1857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1001 aa  223  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  28.38 
 
 		 982 aa  208  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.78 
 
 		 934 aa  204  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1003 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.85 
 
 		 936 aa  200  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  24.35 
 
 		 792 aa  189  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  24.57 
 
 		 937 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  26.07 
 
 		 906 aa  182  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  28.84 
 
 		 967 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  24.52 
 
 		 961 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  25.63 
 
 		 920 aa  167  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  25.71 
 
 		 933 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  26.13 
 
 		 996 aa  167  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  24.39 
 
 		 933 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1106 aa  156  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1279 aa  154  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  24.76 
 
 		 962 aa  151  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  23.46 
 
 		 968 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  24.63 
 
 		 968 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  23.6 
 
 		 848 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  23.42 
 
 		 960 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  22.49 
 
 		 969 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  23.23 
 
 		 965 aa  138  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  25 
 
 		 969 aa  137  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  23.62 
 
 		 972 aa  125  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1012 aa  125  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  21.97 
 
 		 951 aa  123  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  20.43 
 
 		 878 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  30.06 
 
 		 455 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  23.85 
 
 		 947 aa  99.8  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  24.2 
 
 		 561 aa  100  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1008 aa  97.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  23.08 
 
 		 916 aa  95.5  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1045 aa  89  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.48 
 
 		 651 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1071 aa  85.5  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  21.48 
 
 		 894 aa  84.7  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1070 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1001 aa  82  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1118 aa  79  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  22.09 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  23.73 
 
 		 731 aa  76.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  20.07 
 
 		 892 aa  74.7  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  23.94 
 
 		 746 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  26.64 
 
 		 745 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  20.67 
 
 		 737 aa  65.1  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.85 
 
 		 703 aa  62  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.32 
 
 		 739 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  28.64 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  27.27 
 
 		 599 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  24.48 
 
 		 540 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.32 
 
 		 1003 aa  55.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  33.04 
 
 		 194 aa  54.7  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  28.03 
 
 		 920 aa  51.6  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  28.03 
 
 		 920 aa  51.6  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  19.33 
 
 		 979 aa  51.6  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  19.87 
 
 		 747 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  21.05 
 
 		 964 aa  50.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.33 
 
 		 979 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  25.37 
 
 		 596 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.98 
 
 		 383 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  30.33 
 
 		 992 aa  44.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>