61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2991 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  83.49 
 
 		 933 aa  1620    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  48.75 
 
 		 920 aa  837    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  51.82 
 
 		 937 aa  929    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  51.6 
 
 		 951 aa  930    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  48.97 
 
 		 969 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  45.3 
 
 		 961 aa  807    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  51.19 
 
 		 906 aa  885    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  50.63 
 
 		 968 aa  927    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  53.68 
 
 		 962 aa  958    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 933 aa  1919    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  75.18 
 
 		 848 aa  1275    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  71.35 
 
 		 968 aa  1409    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  50.05 
 
 		 972 aa  867    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  51.56 
 
 		 965 aa  915    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  50.05 
 
 		 1012 aa  904    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  51.29 
 
 		 969 aa  929    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  48 
 
 		 960 aa  846    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  55.15 
 
 		 792 aa  886    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  49.82 
 
 		 561 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  48.07 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1001 aa  360  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  31.36 
 
 		 996 aa  347  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1003 aa  313  9e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  31.12 
 
 		 982 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  28.95 
 
 		 967 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0685  hypothetical protein  90.7 
 
 		 146 aa  244  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199679  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  25.36 
 
 		 934 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  24.52 
 
 		 936 aa  226  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  75 
 
 		 194 aa  218  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1279 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1106 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.39 
 
 		 911 aa  164  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  24.39 
 
 		 911 aa  164  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  22.99 
 
 		 878 aa  140  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  25.43 
 
 		 947 aa  127  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  21.92 
 
 		 892 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  25.39 
 
 		 745 aa  104  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  24.61 
 
 		 916 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1001 aa  97.4  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1070 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1118 aa  91.3  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1071 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2191  hypothetical protein  39.29 
 
 		 121 aa  87.8  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1045 aa  85.1  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1008 aa  82.4  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  22.48 
 
 		 731 aa  80.1  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  21.2 
 
 		 747 aa  74.7  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  24.12 
 
 		 894 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.22 
 
 		 737 aa  62  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  28.02 
 
 		 751 aa  60.1  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.95 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  26.52 
 
 		 1003 aa  58.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.3 
 
 		 979 aa  58.2  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.93 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  49.06 
 
 		 964 aa  57.4  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  26.19 
 
 		 746 aa  54.3  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  52.17 
 
 		 979 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  54.35 
 
 		 995 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  51.35 
 
 		 453 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  37.1 
 
 		 614 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  40.74 
 
 		 433 aa  44.3  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>