73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1367 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  100 
 
 		 746 aa  1556    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  44.68 
 
 		 731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  30.73 
 
 		 916 aa  355  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  30.94 
 
 		 878 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  30.66 
 
 		 894 aa  324  3e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  30.5 
 
 		 751 aa  301  4e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  28 
 
 		 892 aa  293  7e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  30.51 
 
 		 737 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  28.34 
 
 		 747 aa  270  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  29.11 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.55 
 
 		 703 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  22.8 
 
 		 934 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1045 aa  138  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  22.15 
 
 		 936 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1071 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1070 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  25.2 
 
 		 982 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1003 aa  127  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1118 aa  124  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  23.83 
 
 		 996 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1106 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  22.71 
 
 		 792 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  27.94 
 
 		 256 aa  98.2  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  22.45 
 
 		 540 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  24.16 
 
 		 852 aa  93.6  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  21.77 
 
 		 937 aa  92.8  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1279 aa  92  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  23.26 
 
 		 920 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  22.93 
 
 		 951 aa  84  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  22.42 
 
 		 968 aa  81.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  21.96 
 
 		 972 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1008 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  22.2 
 
 		 961 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  21.58 
 
 		 969 aa  77.8  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  22.42 
 
 		 906 aa  77.4  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  22.81 
 
 		 965 aa  75.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  28.12 
 
 		 967 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  23.24 
 
 		 911 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  21.55 
 
 		 848 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.24 
 
 		 911 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  28.22 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  26.03 
 
 		 745 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  30.41 
 
 		 947 aa  69.3  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  21.96 
 
 		 960 aa  68.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  23.01 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  21.75 
 
 		 968 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1012 aa  65.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1001 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  24.34 
 
 		 969 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1030 aa  63.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.43 
 
 		 1068 aa  63.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  26.55 
 
 		 962 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  23.1 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1001 aa  58.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  24.58 
 
 		 992 aa  56.6  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  26.19 
 
 		 933 aa  54.7  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  24.79 
 
 		 920 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  24.79 
 
 		 920 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  40 
 
 		 483 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  24.54 
 
 		 596 aa  50.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.83 
 
 		 979 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  24.77 
 
 		 482 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  51.11 
 
 		 416 aa  47.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  34.92 
 
 		 441 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.54 
 
 		 979 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  19.83 
 
 		 1003 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.43 
 
 		 739 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.24 
 
 		 524 aa  45.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  48.72 
 
 		 430 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.61 
 
 		 995 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  53.57 
 
 		 455 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>