184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1386 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 540 aa  1124    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  33.68 
 
 		 596 aa  257  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.25 
 
 		 739 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  25.66 
 
 		 852 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  28.06 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  26.17 
 
 		 916 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  24.11 
 
 		 920 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  24.11 
 
 		 920 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  22.6 
 
 		 947 aa  99.4  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  22.45 
 
 		 746 aa  98.2  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  29.13 
 
 		 599 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.32 
 
 		 1068 aa  94.7  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1030 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  30.67 
 
 		 878 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  33.59 
 
 		 992 aa  78.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  26.25 
 
 		 731 aa  73.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1070 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1071 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1045 aa  69.3  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1118 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  43.84 
 
 		 483 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  30.28 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  22.4 
 
 		 894 aa  65.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  41.76 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  36.73 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.58 
 
 		 703 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  31.15 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  42.03 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  31.15 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  24.51 
 
 		 892 aa  60.5  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.64 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  21.07 
 
 		 967 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.47 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  28.79 
 
 		 934 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  31.15 
 
 		 747 aa  57  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  24.48 
 
 		 911 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.48 
 
 		 911 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.79 
 
 		 293 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.37 
 
 		 651 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.1 
 
 		 315 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  28.03 
 
 		 936 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.42 
 
 		 644 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.73 
 
 		 292 aa  54.7  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  37.65 
 
 		 481 aa  54.3  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1003 aa  54.3  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45 
 
 		 255 aa  53.9  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.75 
 
 		 283 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.65 
 
 		 370 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  23.22 
 
 		 530 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  48.98 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.3 
 
 		 284 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  40.26 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.83 
 
 		 391 aa  51.6  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  39.44 
 
 		 292 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.88 
 
 		 309 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.43 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.28 
 
 		 947 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.75 
 
 		 528 aa  51.2  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.68 
 
 		 222 aa  51.2  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.26 
 
 		 396 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.94 
 
 		 274 aa  50.8  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.83 
 
 		 483 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.18 
 
 		 368 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  37.33 
 
 		 348 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  42.86 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.81 
 
 		 327 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 		 372 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.89 
 
 		 372 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  44.26 
 
 		 352 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  44.26 
 
 		 352 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.86 
 
 		 597 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.31 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.92 
 
 		 239 aa  49.7  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.68 
 
 		 220 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.06 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2250  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.62 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0370672 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  43.1 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1263  DNA methylase  44.26 
 
 		 349 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00126419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.1 
 
 		 276 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.64 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  41.94 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  41.82 
 
 		 218 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  24.06 
 
 		 947 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.81 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.24 
 
 		 276 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  44.9 
 
 		 304 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  24.35 
 
 		 256 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 		 308 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  39.66 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 614 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  42.62 
 
 		 349 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  41.18 
 
 		 281 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  51.02 
 
 		 329 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2150  DNA methylase  43.1 
 
 		 349 aa  47.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209549  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  30.53 
 
 		 482 aa  47.8  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6856  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.94 
 
 		 313 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0555121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  52.38 
 
 		 330 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  40.32 
 
 		 495 aa  47.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>