60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1872 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  890    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  60 
 
 		 475 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  60.8 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  27.2 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  26.46 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  28.4 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  28.19 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  26.34 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  25.56 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  30.89 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  30.89 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  28.29 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  24.19 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  25.48 
 
 		 408 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  26.23 
 
 		 416 aa  92.8  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.63 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.64 
 
 		 877 aa  90.1  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  24.34 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  22.48 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  29.26 
 
 		 512 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  26.58 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  25 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.42 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  24.42 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  27.87 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  22.71 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.97 
 
 		 947 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  24.33 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  20.88 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  21.78 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  27.59 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  26.94 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  25 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  25.39 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  22.73 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.16 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  22.39 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  25.96 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  21.5 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  35.94 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  22.19 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  27.23 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  39.66 
 
 		 540 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  24.58 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  38.57 
 
 		 345 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  34.85 
 
 		 110 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.21 
 
 		 371 aa  47  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  30.43 
 
 		 412 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.07 
 
 		 372 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  34.21 
 
 		 878 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.14 
 
 		 524 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  23.43 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.39 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  35.48 
 
 		 894 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  36.51 
 
 		 892 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  35.29 
 
 		 596 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  29.27 
 
 		 535 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  23.01 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.53 
 
 		 739 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>