75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1772 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 
916 aa  1889    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  42.9 
 
 
878 aa  743    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  34.64 
 
 
892 aa  522  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  33.7 
 
 
894 aa  515  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  32.58 
 
 
731 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  30.73 
 
 
746 aa  345  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  28.38 
 
 
737 aa  321  5e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  27.69 
 
 
751 aa  311  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  28.26 
 
 
747 aa  293  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  31.36 
 
 
1071 aa  268  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  30.28 
 
 
1045 aa  267  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  29.83 
 
 
1070 aa  265  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  33.82 
 
 
1118 aa  262  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.7 
 
 
651 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.51 
 
 
703 aa  241  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  22.62 
 
 
936 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  23.49 
 
 
934 aa  191  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  22.48 
 
 
1003 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  22.9 
 
 
1001 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  23.13 
 
 
982 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  22.78 
 
 
792 aa  158  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  22.28 
 
 
996 aa  152  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  21.45 
 
 
937 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  23.7 
 
 
1279 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  22.57 
 
 
1106 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  22.71 
 
 
610 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  23.78 
 
 
967 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  21.11 
 
 
906 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  23.47 
 
 
961 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  21.79 
 
 
920 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  22.47 
 
 
972 aa  121  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  21.3 
 
 
968 aa  118  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  21.37 
 
 
960 aa  118  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  21.14 
 
 
848 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  20.65 
 
 
968 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  21.22 
 
 
951 aa  115  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  22.18 
 
 
965 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  20.74 
 
 
969 aa  109  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  21.09 
 
 
962 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  22.52 
 
 
1008 aa  106  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.89 
 
 
1068 aa  106  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  24.38 
 
 
933 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  26.17 
 
 
540 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  24.61 
 
 
933 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  22.88 
 
 
911 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  22.88 
 
 
911 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  21.38 
 
 
969 aa  94.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  28.36 
 
 
852 aa  91.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  20.45 
 
 
561 aa  91.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.43 
 
 
979 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  23.05 
 
 
964 aa  90.1  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  28.57 
 
 
1030 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.06 
 
 
979 aa  84.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  24.52 
 
 
596 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  25.76 
 
 
599 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  23.04 
 
 
992 aa  79.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  22.19 
 
 
1012 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  21.79 
 
 
995 aa  77.4  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  20.82 
 
 
1003 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  22.16 
 
 
745 aa  72.4  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3423  hypothetical protein  23.11 
 
 
256 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  21.7 
 
 
1001 aa  68.6  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  27.72 
 
 
947 aa  67.8  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  23.53 
 
 
920 aa  67.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  23.53 
 
 
920 aa  67.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  23.83 
 
 
947 aa  63.9  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.56 
 
 
739 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  24.12 
 
 
455 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  24.47 
 
 
501 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  28.66 
 
 
393 aa  53.9  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  28.47 
 
 
194 aa  52  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  41.51 
 
 
483 aa  52  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0504  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  42.86 
 
 
50 aa  48.9  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  24.51 
 
 
407 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>