More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0803 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  100 
 
 		 436 aa  900    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.74 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  50.61 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  49.43 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.68 
 
 		 483 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.03 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  36.28 
 
 		 459 aa  242  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  36.57 
 
 		 421 aa  237  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.64 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  37.44 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  35.82 
 
 		 409 aa  223  6e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  34.75 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  32.95 
 
 		 408 aa  209  6e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  33.49 
 
 		 421 aa  207  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.14 
 
 		 471 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  32.59 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  32.37 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  32.24 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  32.02 
 
 		 448 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.82 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  31.72 
 
 		 411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  31.36 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  31.36 
 
 		 452 aa  183  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  31.36 
 
 		 452 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  29.66 
 
 		 470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  29.61 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  30.15 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  46.34 
 
 		 222 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.98 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.38 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  28.64 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  28.91 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.68 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.27 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  27.78 
 
 		 417 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  46.74 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  42.28 
 
 		 196 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  47.62 
 
 		 200 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  49.61 
 
 		 169 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  46.03 
 
 		 203 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  56.84 
 
 		 177 aa  114  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  45.16 
 
 		 183 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  44.27 
 
 		 247 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  25.8 
 
 		 684 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  41.22 
 
 		 178 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  39.86 
 
 		 184 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  39.58 
 
 		 212 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  48.61 
 
 		 87 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.89 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  28.38 
 
 		 243 aa  83.2  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  28.38 
 
 		 243 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  38.71 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  36.29 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.8 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.5 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.8 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.39 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  47.37 
 
 		 131 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  49.21 
 
 		 77 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  36.04 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.58 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.14 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.75 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  28.83 
 
 		 236 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  34.92 
 
 		 222 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.69 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.25 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.06 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.99 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.11 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.59 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.38 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  26.38 
 
 		 283 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  26.38 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.38 
 
 		 283 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.91 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.16 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.66 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.82 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.19 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  28.86 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1423  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.89 
 
 		 237 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  28.24 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.69 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.38 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.47 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.98 
 
 		 255 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  29.53 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0913  site-specific DNA-methyltransferase  31.9 
 
 		 173 aa  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  29.53 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  28.11 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.66 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.22 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.67 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.5 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  27.42 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.29 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.34 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.34 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  38.39 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>