189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2276 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
403 aa  816    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  66.42 
 
 
447 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  63.12 
 
 
471 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  65.4 
 
 
441 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.13 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  32.27 
 
 
459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  29.38 
 
 
421 aa  150  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.41 
 
 
488 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  30.27 
 
 
436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  30.69 
 
 
432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  55.24 
 
 
222 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  31.37 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  30.35 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  49.64 
 
 
452 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  49.64 
 
 
452 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  49.64 
 
 
452 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  49.64 
 
 
448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  49.64 
 
 
448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  50.35 
 
 
421 aa  127  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.12 
 
 
483 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.71 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  40.11 
 
 
463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  26.4 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  41.57 
 
 
411 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
421 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  27.75 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.79 
 
 
412 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.53 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  43.88 
 
 
444 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  43.88 
 
 
444 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  41.43 
 
 
684 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  36.69 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  25.27 
 
 
408 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.34 
 
 
292 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.52 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  30.81 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  30.08 
 
 
396 aa  89.7  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.62 
 
 
597 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.57 
 
 
274 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.65 
 
 
276 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.31 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  30.94 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.16 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.48 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  51.95 
 
 
196 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  31.85 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  49.35 
 
 
183 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  51.56 
 
 
203 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.32 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  24.53 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  54.24 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.41 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  42.86 
 
 
212 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.55 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  48.44 
 
 
169 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.31 
 
 
281 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.37 
 
 
292 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  43.75 
 
 
184 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.89 
 
 
302 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.65 
 
 
441 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.45 
 
 
308 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.45 
 
 
308 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.34 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.61 
 
 
271 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.61 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.97 
 
 
416 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.71 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  48.44 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  25.55 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  63.27 
 
 
200 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6269  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.48 
 
 
333 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  23.55 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  21.51 
 
 
451 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3337  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
345 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149909  unclonable  0.0000000199825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3185  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.06 
 
 
394 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.5 
 
 
395 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5389  DNA methylase N-4/N-6  25.56 
 
 
355 aa  57  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.352939 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.13 
 
 
255 aa  57  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0407  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.63 
 
 
338 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0646308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  22.16 
 
 
373 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.25 
 
 
849 aa  56.2  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2524  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.26 
 
 
368 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000139446  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.42 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.66 
 
 
329 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  34.07 
 
 
309 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  20.7 
 
 
284 aa  55.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  21.19 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  36.78 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  36.78 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  36.78 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  36.78 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  36.78 
 
 
294 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.3 
 
 
308 aa  54.3  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.29 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3519  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.4 
 
 
331 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000244279  normal  0.486943 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  35.63 
 
 
294 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  35.63 
 
 
294 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  35.63 
 
 
294 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.98 
 
 
222 aa  53.9  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  35.63 
 
 
294 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>