55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02830 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  100 
 
 		 410 aa  858    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0971  hypothetical protein  44.13 
 
 		 222 aa  189  7e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  47.06 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  41.48 
 
 		 183 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  43.85 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  43.65 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  45.38 
 
 		 452 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  45.38 
 
 		 452 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  42.52 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  45.38 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  45.38 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  45.38 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  42.42 
 
 		 200 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.62 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  43.7 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  39.2 
 
 		 247 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  40.98 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  42.4 
 
 		 178 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.4 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.98 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  38.28 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  42.06 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.3 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  36.23 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  37.4 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  36.28 
 
 		 177 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  32.56 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  37.6 
 
 		 169 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  35.97 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  43.02 
 
 		 87 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  36.04 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  40.91 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  38.21 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  33.87 
 
 		 196 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  34.62 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  29.41 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  31.5 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  31.51 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  34.17 
 
 		 222 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  28.68 
 
 		 684 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  29.03 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  30.28 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  32.28 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  28.03 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.03 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.94 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2791  putative filamentous haemagglutinin  36.76 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.258369  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  28.7 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  28.7 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  26.32 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  25 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  32.31 
 
 		 273 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>