152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0959 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0959  nuclease  100 
 
 
396 aa  813    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 
464 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.75 
 
 
425 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.69 
 
 
421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  34.84 
 
 
421 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  35.4 
 
 
411 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  34.16 
 
 
459 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  30.92 
 
 
421 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  35.01 
 
 
435 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  30.48 
 
 
463 aa  186  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  29.61 
 
 
436 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  31.52 
 
 
470 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.88 
 
 
488 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  32.17 
 
 
409 aa  168  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  32.09 
 
 
408 aa  164  3e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  26.94 
 
 
444 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  26.71 
 
 
444 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  28.34 
 
 
452 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  28.34 
 
 
452 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  28.34 
 
 
452 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  28.1 
 
 
448 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.17 
 
 
471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  28.03 
 
 
448 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  29.74 
 
 
411 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  39.39 
 
 
222 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.93 
 
 
483 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.9 
 
 
413 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  30.39 
 
 
413 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  29.65 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.68 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  28.5 
 
 
411 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  28 
 
 
447 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  28.12 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  27.95 
 
 
441 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  27.99 
 
 
432 aa  126  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  43.44 
 
 
183 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  31.66 
 
 
684 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  44.72 
 
 
247 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  44.14 
 
 
177 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  42.62 
 
 
203 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  36.67 
 
 
169 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  42.06 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  36.36 
 
 
196 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.08 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  36.13 
 
 
178 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  34.43 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  38.84 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  30.91 
 
 
184 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  34.31 
 
 
212 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  45.07 
 
 
94 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  45.07 
 
 
94 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  32.86 
 
 
196 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  35.96 
 
 
222 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  39.76 
 
 
87 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  27.01 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  39.19 
 
 
131 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  39.73 
 
 
77 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.47 
 
 
222 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0988  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.33 
 
 
225 aa  56.6  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0151076  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  36.25 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  36.25 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  36.25 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  36.25 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  36.25 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  36.25 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.12 
 
 
226 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 
256 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  36.25 
 
 
258 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  36.25 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  34.29 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.25 
 
 
305 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.72 
 
 
253 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.27 
 
 
323 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  34.29 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  36.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  36.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2741  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.76 
 
 
262 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.25 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  26.67 
 
 
215 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 
273 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.68 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2900  prophage MuMc02, DNA methyltransferase  35.06 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2588  ParB family protein  23.33 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1070  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25 
 
 
223 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.95 
 
 
301 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.29 
 
 
273 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  30.95 
 
 
301 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.67 
 
 
309 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.32 
 
 
315 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.23 
 
 
352 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.63 
 
 
283 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.9 
 
 
255 aa  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  37.68 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.68 
 
 
225 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.37 
 
 
274 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>