265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0878 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 		 464 aa  952    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  54.04 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  48.74 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  50.24 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.22 
 
 		 483 aa  326  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.21 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  45.19 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.99 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  41.18 
 
 		 459 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  41.96 
 
 		 411 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  38.55 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  35.92 
 
 		 448 aa  262  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  35.73 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  35.73 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  35.73 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  35.7 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  36.36 
 
 		 421 aa  250  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  34.74 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  36.22 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  33.88 
 
 		 408 aa  243  5e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  36.22 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.77 
 
 		 471 aa  243  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  35.21 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  33.33 
 
 		 411 aa  217  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  35.62 
 
 		 447 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  50.75 
 
 		 222 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.9 
 
 		 413 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.64 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  31.81 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  31.48 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  31.05 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  30.61 
 
 		 470 aa  183  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.13 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  29.02 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  29.86 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  45.51 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  32.85 
 
 		 684 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  47.83 
 
 		 196 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  52.17 
 
 		 183 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  54.84 
 
 		 247 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  46.3 
 
 		 178 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  44.35 
 
 		 203 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  43.15 
 
 		 200 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  50.43 
 
 		 169 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  51.82 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  47.1 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  40.74 
 
 		 184 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  41.84 
 
 		 212 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  43.4 
 
 		 410 aa  90.1  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  33.58 
 
 		 196 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  51.95 
 
 		 87 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  53.62 
 
 		 131 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  54.41 
 
 		 77 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.71 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.63 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  38 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.54 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.92 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.8 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.17 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  28.33 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3684  putative methyltransferase  27.2 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220289  normal  0.0704128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3577  putative methyltransferase  27.2 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3747  putative methyltransferase  27.2 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00189132  normal  0.187537 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3578  putative methyltransferase  27.2 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0177776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.09 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3650  putative methyltransferase  27.2 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000365024  hitchhiker  0.00241657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.82 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.27 
 
 		 239 aa  69.7  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0682  DNA methylase N-4/N-6  30.37 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  27.2 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.57 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0420  site-specific DNA-methyltransferase  29.48 
 
 		 243 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3693  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.09 
 
 		 332 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00816735  hitchhiker  0.000000112456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.66 
 
 		 322 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.76 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  26.05 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 		 282 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.45 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4855  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.3 
 
 		 249 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.862856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.45 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.36 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1486  site-specific DNA-methyltransferase  29.27 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.6 
 
 		 243 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.48 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  26.44 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.72 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  21.86 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  26.44 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  26.72 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  26.44 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  26.44 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  26.44 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  26.44 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  28.12 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1229  DNA methylase  21.6 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0186  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.87 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  24.4 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.7 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>